公开(公告)号：US09194772B2

公开(公告)日：2015-11-24

申请号：US12557488

申请日：2009-09-10

申请人： Linda Lee ,  Sam Woo ,  Congcong Ma ,  Richard Reel ,  Mark Oldham ,  David Cox ,  Benjamin Schroeder ,  Jon Sorenson ,  Willy Wiyatno

发明人： Linda Lee ,  Sam Woo ,  Congcong Ma ,  Richard Reel ,  Mark Oldham ,  David Cox ,  Benjamin Schroeder ,  Jon Sorenson ,  Willy Wiyatno

IPC分类号： C12Q1/68 ,  C12M1/34 ,  G01N1/14 ,  B01L3/00 ,  F15C5/00 ,  F16K99/00 ,  G01N35/08 ,  B01L3/02 ,  B01L7/00

CPC分类号： C12Q1/6869 ,  B01J2219/00353 ,  B01J2219/0036 ,  B01J2219/00364 ,  B01J2219/00608 ,  B01J2219/0061 ,  B01J2219/00612 ,  B01J2219/00619 ,  B01J2219/00626 ,  B01J2219/00637 ,  B01J2219/00653 ,  B01J2219/00657 ,  B01J2219/00659 ,  B01L3/0293 ,  B01L3/502715 ,  B01L3/502784 ,  B01L7/52 ,  B01L2200/0673 ,  B01L2200/10 ,  B01L2300/0864 ,  B01L2300/0867 ,  B01L2400/0421 ,  B01L2400/0487 ,  C12Q1/6806 ,  C12Q1/6874 ,  F15C5/00 ,  F16K99/0001 ,  F16K99/0011 ,  F16K99/0013 ,  F16K2099/0084 ,  G01N1/14 ,  G01N27/44743 ,  G01N27/44769 ,  G01N35/08 ,  Y10T137/0318 ,  Y10T137/4259 ,  Y10T137/85978 ,  Y10T137/85986 ,  Y10T137/86863 ,  Y10T436/2575 ,  C12Q2535/101

摘要： Various embodiments of the teachings relate to a system or method for sample preparation or analysis in biochemical or molecular biology procedures. The sample preparation can involve small volume processed in discrete portions or segments or slugs, herein referred to as discrete volumes. A molecular biology procedure can be nucleic acid analysis. Nucleic acid analysis can be an integrated DNA amplification/DNA sequencing procedure.

摘要翻译： 本发明的各种实施方案涉及生物化学或分子生物学程序中用于样品制备或分析的系统或方法。 样品制备可以涉及在离散部分或段或块中的小体积处理，在本文中称为离散体积。 分子生物学程序可以是核酸分析。 核酸分析可以是一个综合的DNA扩增/ DNA测序程序。

公开(公告)号：US20070141593A1

公开(公告)日：2007-06-21

申请号：US11507735

申请日：2006-08-22

申请人： Linda Lee ,  Sam Woo ,  Congcong Ma ,  Richard Reel ,  Mark Oldham ,  David Cox ,  Benjamin Schroeder ,  Jon Sorenson ,  Willy Wiyatno

发明人： Linda Lee ,  Sam Woo ,  Congcong Ma ,  Richard Reel ,  Mark Oldham ,  David Cox ,  Benjamin Schroeder ,  Jon Sorenson ,  Willy Wiyatno

IPC分类号： C12Q1/68

CPC分类号： C12Q1/6869 ,  B01J2219/00353 ,  B01J2219/0036 ,  B01J2219/00364 ,  B01J2219/00608 ,  B01J2219/0061 ,  B01J2219/00612 ,  B01J2219/00619 ,  B01J2219/00626 ,  B01J2219/00637 ,  B01J2219/00653 ,  B01J2219/00657 ,  B01J2219/00659 ,  B01L3/0293 ,  B01L3/502715 ,  B01L3/502784 ,  B01L7/52 ,  B01L2200/0673 ,  B01L2200/10 ,  B01L2300/0864 ,  B01L2300/0867 ,  B01L2400/0421 ,  B01L2400/0487 ,  C12Q1/6806 ,  C12Q1/6874 ,  C12Q2535/101 ,  F15C5/00 ,  F16K99/0001 ,  F16K99/0011 ,  F16K99/0013 ,  F16K2099/0084 ,  G01N1/14 ,  G01N27/44743 ,  G01N27/44769 ,  G01N35/08 ,  Y10T137/0318 ,  Y10T137/4259 ,  Y10T137/85978 ,  Y10T137/85986 ,  Y10T137/86863 ,  Y10T436/2575

摘要： Various embodiments of the teachings relate to a system or method for sample preparation or analysis in biochemical or molecular biology procedures. The sample preparation can involve small volume processed in discrete portions or segments or slugs, herein referred to as discrete volumes. A molecular biology procedure can be nucleic acid analysis. Nucleic acid analysis can be an integrated DNA amplification/DNA sequencing procedure.

摘要翻译： 本发明的各种实施方案涉及生物化学或分子生物学程序中用于样品制备或分析的系统或方法。 样品制备可以涉及在离散部分或段或块中的小体积处理，在本文中称为离散体积。 分子生物学程序可以是核酸分析。 核酸分析可以是一个综合的DNA扩增/ DNA测序程序。

公开(公告)号：US08361807B2

公开(公告)日：2013-01-29

申请号：US13069213

申请日：2011-03-22

申请人： Willy Wiyatno ,  Linda Lee ,  David Cox ,  Richard Reel ,  Mark Oldham ,  Jim Nurse ,  Douglas Greiner ,  Dennis Lehto ,  Janusz Wojtowicz ,  Sam Woo

发明人： Willy Wiyatno ,  Linda Lee ,  David Cox ,  Richard Reel ,  Mark Oldham ,  Jim Nurse ,  Douglas Greiner ,  Dennis Lehto ,  Janusz Wojtowicz ,  Sam Woo

IPC分类号： G01N1/14 ,  G01N1/28

CPC分类号： C12Q1/6869 ,  B01J2219/00353 ,  B01J2219/0036 ,  B01J2219/00364 ,  B01J2219/00608 ,  B01J2219/0061 ,  B01J2219/00612 ,  B01J2219/00619 ,  B01J2219/00626 ,  B01J2219/00637 ,  B01J2219/00653 ,  B01J2219/00657 ,  B01J2219/00659 ,  B01L3/0293 ,  B01L3/502715 ,  B01L3/502784 ,  B01L7/52 ,  B01L2200/0673 ,  B01L2200/10 ,  B01L2300/0864 ,  B01L2300/0867 ,  B01L2400/0421 ,  B01L2400/0487 ,  C12Q1/6806 ,  C12Q1/6874 ,  F15C5/00 ,  F16K99/0001 ,  F16K99/0011 ,  F16K99/0013 ,  F16K2099/0084 ,  G01N1/14 ,  G01N27/44743 ,  G01N27/44769 ,  G01N35/08 ,  Y10T137/0318 ,  Y10T137/4259 ,  Y10T137/85978 ,  Y10T137/85986 ,  Y10T137/86863 ,  Y10T436/2575 ,  C12Q2535/101

摘要： Various embodiments described in the application relate to an apparatus, system, and method for generating, within a conduit, discrete volumes of one or more fluids that are immiscible with a second fluid. The discrete volumes can be used for biochemical or molecular biology procedures involving small volumes, for example, microliter-sized volumes, nanoliter-sized volumes, or smaller. The system can comprise an apparatus comprising at least one conduit operatively connected to one or more pumps for providing discrete volumes separated from one another by a fluid that is immiscible with the fluid(s) of the discrete volumes, for example, aqueous immiscible-fluid-discrete volumes separated by an oil.

公开(公告)号：US20070068573A1

公开(公告)日：2007-03-29

申请号：US11508756

申请日：2006-08-22

申请人： David Cox ,  Sam Woo ,  Steven Boege ,  Mark Oldham ,  Richard Reel ,  Eric Nordman ,  Linda Lee ,  Willy Wiyatno ,  Dmitry Sagatelyan

发明人： David Cox ,  Sam Woo ,  Steven Boege ,  Mark Oldham ,  Richard Reel ,  Eric Nordman ,  Linda Lee ,  Willy Wiyatno ,  Dmitry Sagatelyan

IPC分类号： F17D1/00

CPC分类号： C12Q1/6869 ,  B01J2219/00353 ,  B01J2219/0036 ,  B01J2219/00364 ,  B01J2219/00608 ,  B01J2219/0061 ,  B01J2219/00612 ,  B01J2219/00619 ,  B01J2219/00626 ,  B01J2219/00637 ,  B01J2219/00653 ,  B01J2219/00657 ,  B01J2219/00659 ,  B01L3/0293 ,  B01L3/502715 ,  B01L3/502784 ,  B01L7/52 ,  B01L2200/0673 ,  B01L2200/10 ,  B01L2300/0864 ,  B01L2300/0867 ,  B01L2400/0421 ,  B01L2400/0487 ,  C12Q1/6806 ,  C12Q1/6874 ,  C12Q2535/101 ,  F15C5/00 ,  F16K99/0001 ,  F16K99/0011 ,  F16K99/0013 ,  F16K2099/0084 ,  G01N1/14 ,  G01N27/44743 ,  G01N27/44769 ,  G01N35/08 ,  Y10T137/0318 ,  Y10T137/4259 ,  Y10T137/85978 ,  Y10T137/85986 ,  Y10T137/86863 ,  Y10T436/2575

摘要： Various embodiments described in the application relate to an apparatus, system, and method for fluidically controlling, within a conduit, discrete volumes of one or more fluids that are immiscible with a second fluid. The discrete volumes can be used for biochemical or molecular biology procedures involving small volumes, for example, microliter-sized volumes, nanoliter-sized volumes, or smaller. The system can comprise combinations of detectors, controllers, valves, and fluid supply units to control the spatial size, location and/or fluidic composition of discrete volumes separated from one another by a fluid that is immiscible with the fluid(s) of the discrete volumes, for example, aqueous immiscible-fluid-discrete volumes separated by an oil.

摘要翻译： 在本申请中描述的各种实施例涉及用于在管道内流体控制与第二流体不混溶的一种或多种流体的离散体积的装置，系统和方法。 离散体积可用于涉及小体积的生物化学或分子生物学过程，例如微升体积，纳升级体积或更小体积。 该系统可以包括检测器，控制器，阀和流体供应单元的组合，以控制通过与离散的流体不混溶的流体彼此分离的离散体积的空间尺寸，位置和/或流体组成 体积，例如由油分离的含水不混溶流体离散体积。

公开(公告)号：US20070062583A1

公开(公告)日：2007-03-22

申请号：US11508044

申请日：2006-08-22

申请人： David Cox ,  Willy Wiyatno ,  Mark Oldham ,  James Nurse ,  Douglas Greiner ,  Sam Woo ,  Richard Reel ,  Dennis Lehto ,  Linda Lee ,  Janusz Wojtowicz

发明人： David Cox ,  Willy Wiyatno ,  Mark Oldham ,  James Nurse ,  Douglas Greiner ,  Sam Woo ,  Richard Reel ,  Dennis Lehto ,  Linda Lee ,  Janusz Wojtowicz

IPC分类号： G01N1/28 ,  G01N1/14

CPC分类号： C12Q1/6869 ,  B01J2219/00353 ,  B01J2219/0036 ,  B01J2219/00364 ,  B01J2219/00608 ,  B01J2219/0061 ,  B01J2219/00612 ,  B01J2219/00619 ,  B01J2219/00626 ,  B01J2219/00637 ,  B01J2219/00653 ,  B01J2219/00657 ,  B01J2219/00659 ,  B01L3/0293 ,  B01L3/502715 ,  B01L3/502784 ,  B01L7/52 ,  B01L2200/0673 ,  B01L2200/10 ,  B01L2300/0864 ,  B01L2300/0867 ,  B01L2400/0421 ,  B01L2400/0487 ,  C12Q1/6806 ,  C12Q1/6874 ,  F15C5/00 ,  F16K99/0001 ,  F16K99/0011 ,  F16K99/0013 ,  F16K2099/0084 ,  G01N1/14 ,  G01N27/44743 ,  G01N27/44769 ,  G01N35/08 ,  Y10T137/0318 ,  Y10T137/4259 ,  Y10T137/85978 ,  Y10T137/85986 ,  Y10T137/86863 ,  Y10T436/2575 ,  C12Q2535/101

摘要： Various embodiments described in the application relate to an apparatus, system, and method for generating, within a conduit, discrete volumes of one or more fluids that are immiscible with a second fluid. The discrete volumes can be used for biochemical or molecular biology procedures involving small volumes, for example, microliter-sized volumes, nanoliter-sized volumes, or smaller. The system can comprise an apparatus comprising at least one conduit operatively connected to one or more pumps for providing discrete volumes separated from one another by a fluid that is immiscible with the fluid(s) of the discrete volumes, for example, aqueous immiscible-fluid-discrete volumes separated by an oil.

摘要翻译： 在本申请中描述的各种实施例涉及用于在管道内产生与第二流体不混溶的一种或多种流体的离散体积的装置，系统和方法。 离散体积可用于涉及小体积的生物化学或分子生物学过程，例如微升体积，纳升级体积或更小体积。 该系统可以包括一种装置，该装置包括至少一个导管，其操作地连接到一个或多个泵，用于提供通过与离散体积的流体不混溶的流体彼此分离的离散体积，例如水不混溶流体 - 油分离体积。

公开(公告)号：US20070039866A1

公开(公告)日：2007-02-22

申请号：US11507733

申请日：2006-08-22

申请人： Benjamin Schroeder ,  David Cox ,  Mark Oldham ,  Richard Reel ,  Willy Wiyatno

发明人： Benjamin Schroeder ,  David Cox ,  Mark Oldham ,  Richard Reel ,  Willy Wiyatno

IPC分类号： B01D24/00

CPC分类号： C12Q1/6869 ,  B01J2219/00353 ,  B01J2219/0036 ,  B01J2219/00364 ,  B01J2219/00608 ,  B01J2219/0061 ,  B01J2219/00612 ,  B01J2219/00619 ,  B01J2219/00626 ,  B01J2219/00637 ,  B01J2219/00653 ,  B01J2219/00657 ,  B01J2219/00659 ,  B01L3/0293 ,  B01L3/502715 ,  B01L3/502784 ,  B01L7/52 ,  B01L2200/0673 ,  B01L2200/10 ,  B01L2300/0864 ,  B01L2300/0867 ,  B01L2400/0421 ,  B01L2400/0487 ,  C12Q1/6806 ,  C12Q1/6874 ,  F15C5/00 ,  F16K99/0001 ,  F16K99/0011 ,  F16K99/0013 ,  F16K2099/0084 ,  G01N1/14 ,  G01N27/44743 ,  G01N27/44769 ,  G01N35/08 ,  Y10T137/0318 ,  Y10T137/4259 ,  Y10T137/85978 ,  Y10T137/85986 ,  Y10T137/86863 ,  Y10T436/2575 ,  C12Q2535/101

摘要： Various embodiments relate to systems and/or methods for sample preparation that can be used for biochemical and/or molecular biology procedures involving small volumes, for example, micro volumes or smaller. Methods and systems that can reduce sample size requirements and increase the number of samples on a substrate are provided. Samples can be applied to a plate or other appropriate substrate and can be used for, inter alia, sequencing reactions. In some embodiments, apparatuses, systems, and/or methods for charged analyte collection are provided. Charged analytes in a sample can be electrokinetically collected or extracted from a conduit through a hole formed in a sidewall of the conduit, by application of an electric field that causes the charged analytes to migrate in a direction that is transverse to the conduit.

摘要翻译： 各种实施方案涉及用于样品制备的系​​统和/或方法，其可用于涉及小体积例如微量或更小的生物化学和/或分子生物学过程。 提供了可以减少样品尺寸要求并增加基材上样品数量的方法和系统。 样品可以施用于板或其它合适的底物，并且可以用于尤其是测序反应。 在一些实施例中，提供了用于带电分析物收集的装置，系统和/或方法。 通过施加导致带电分析物沿横向于导管的方向迁移的电场，样品中的带电分析物可以通过形成在导管侧壁中的孔从导管电动收集或提取。

公开(公告)号：US08384898B2

公开(公告)日：2013-02-26

申请号：US13442107

申请日：2012-04-09

申请人： Mark Oldham ,  Eric Nordman ,  Richard Reel ,  Janice Shigeura

发明人： Mark Oldham ,  Eric Nordman ,  Richard Reel ,  John Shigeura

IPC分类号： G01N21/00

CPC分类号： G01N27/44721 ,  B82Y10/00 ,  B82Y20/00 ,  G01N2015/149 ,  G01N2015/1497

摘要： An apparatus for detecting labeled beads is provided. The apparatus can include: one or more irradiation sources disposed for irradiating the one or more detection zones with radiation; at least one detector disposed for collecting charges corresponding to light signals emitted from labeled beads in the one or more detection zones, which have been excited by the radiation; and a system coupled to the at least one detector for effecting time delay integration of the charges by accumulating the charges before reading the charges at the output of the at least one detector.

摘要翻译： 提供了一种用于检测标记珠粒的装置。 该装置可以包括：一个或多个辐射源，被设置用于用辐射照射一个或多个检测区域; 至少一个检测器被设置用于收集对应于已经被辐射激发的一个或多个检测区域中的标记珠子发射的光信号的电荷; 以及耦合到所述至少一个检测器的系统，用于通过在读取至少一个检测器的输出端的电荷之前累积电荷来实现电荷的时间延迟积分。

公开(公告)号：US08384899B2

公开(公告)日：2013-02-26

申请号：US13442143

申请日：2012-04-09

申请人： Mark Oldham ,  Eric Nordman ,  Richard Reel ,  Janice Shigeura

发明人： Mark Oldham ,  Eric Nordman ,  Richard Reel ,  John Shigeura

IPC分类号： G01N21/00

CPC分类号： G01N27/44721 ,  B82Y10/00 ,  B82Y20/00 ,  G01N2015/149 ,  G01N2015/1497

摘要： An apparatus for detecting labeled beads is provided. The apparatus can include: one or more irradiation sources disposed for irradiating the one or more detection zones with radiation; at least one detector disposed for collecting charges corresponding to light signals emitted from labeled beads in the one or more detection zones, which have been excited by the radiation; and a system coupled to the at least one detector for effecting time delay integration of the charges by accumulating the charges before reading the charges at the output of the at least one detector.

公开(公告)号：US08169610B2

公开(公告)日：2012-05-01

申请号：US13153902

申请日：2011-06-06

申请人： Mark Oldham ,  Eric Nordman ,  Richard Reel ,  John Shigeura ,  Janice Shigeura, legal representative

发明人： Mark Oldham ,  Eric Nordman ,  Richard Reel ,  John Shigeura

IPC分类号： G01N21/00

CPC分类号： G01N27/44721 ,  B82Y10/00 ,  B82Y20/00 ,  G01N2015/149 ,  G01N2015/1497

摘要： An apparatus for detecting labeled beads is provided. The apparatus can include: one or more irradiation sources disposed for irradiating the one or more detection zones with radiation; at least one detector disposed for collecting charges corresponding to light signals emitted from labeled beads in the one or more detection zones, which have been excited by the radiation; and a system coupled to the at least one detector for effecting time delay integration of the charges by accumulating the charges before reading the charges at the output of the at least one detector.

摘要翻译： 提供了一种用于检测标记珠粒的装置。 该装置可以包括：一个或多个辐射源，被设置用于用辐射照射一个或多个检测区域; 至少一个检测器被设置用于收集对应于已经被辐射激发的一个或多个检测区域中的标记珠子发射的光信号的电荷; 以及耦合到所述至少一个检测器的系统，用于通过在读取至少一个检测器的输出端的电荷之前累积电荷来实现电荷的时间延迟积分。

公开(公告)号：US20050170495A1

公开(公告)日：2005-08-04

申请号：US11096341

申请日：2005-03-31

申请人： Mark Oldham ,  Richard Reel ,  Steven Boege

发明人： Mark Oldham ,  Richard Reel ,  Steven Boege

IPC分类号： B01L7/00 ,  G01N21/25 ,  G01N21/64 ,  G02B3/00 ,  G02B3/08 ,  C12M1/34

CPC分类号： G01N21/6452 ,  B01L7/52 ,  B01L2300/046 ,  B01L2300/0654 ,  B01L2300/0829 ,  G01N21/253 ,  G02B3/0056 ,  G02B3/08

摘要： The invention relates to an optical detection system for a thermal cycling device including at least one light source, a light detection device for detecting light received from a plurality of biological samples, and a lens having a plurality of focusing lens segments greater than the plurality of biological samples to direct light into the plurality of biological samples.

摘要翻译： 本发明涉及一种用于热循环装置的光学检测系统，其包括至少一个光源，用于检测从多个生物样本接收的光的光检测装置，以及具有大于多个生物样本的多个聚焦透镜段的透镜 生物样品将光引导到多个生物样品中。