公开(公告)号：US07691580B2

公开(公告)日：2010-04-06

申请号：US10353496

申请日：2003-01-29

申请人： Ye Fang ,  Brian L. Webb

发明人： Ye Fang ,  Brian L. Webb

IPC分类号： G01N33/53

CPC分类号： G01N33/5005 ,  G01N33/5432

摘要： Systems, methods and kits that utilize uniquely coded microparticles for performing protein assays are provided. The uniquely coded microparticles are used as a substrate for reverse protein delivery into cells. The microparticles and methods offer the possibility of studying the biological functions of either a single protein of interest in multiple cell types per assay or multiple proteins in a single cell type.

摘要翻译： 提供了使用唯一编码的微粒进行蛋白质测定的系统，方法和试剂盒。 唯一编码的微粒用作反向蛋白递送到细胞中的底物。 微粒和方法提供了研究在每种测定的多种细胞类型中的单一目的蛋白或单细胞类型的多种蛋白质的生物学功能的可能性。

公开(公告)号：US20060229818A1

公开(公告)日：2006-10-12

申请号：US11101096

申请日：2005-04-07

申请人： Ye Fang ,  Ann Ferrie ,  Norman Fontaine ,  Anthony Frutos ,  Eric Mozdy ,  Chuan-Che Wang ,  Po Yuen

发明人： Ye Fang ,  Ann Ferrie ,  Norman Fontaine ,  Anthony Frutos ,  Eric Mozdy ,  Chuan-Che Wang ,  Po Yuen

IPC分类号： G06F19/00

CPC分类号： G01N21/7743 ,  G01N21/253

摘要： The present invention includes several methods for modifying the current processes of manufacturing optical sensing microplates that use continuous waveguide films to reduce/eliminate crosstalk between the biosensors that are incorporated within wells. The methods include (1) physically deteriorating/removing the waveguide film between individual biosensors; (2) chemically depositing highly absorbing materials within the waveguide film between individual biosensors; (3) patterning disordered (scattering) regions between the diffraction gratings that define individual biosensors; (4) using a specific mask and depositing individual patches of waveguide film, where each patch defines at least one biosensor. Each of these methods and several other methods described herein prevent the propagation of light between individual sensing regions, thereby eliminating optical crosstalk between the biosensors. The present invention also includes the resulting microplate.

摘要翻译： 本发明包括几种用于修改制造光学感测微板的当前工艺的方法，其使用连续波导膜来减少/消除结合在孔内的生物传感器之间的串扰。 所述方法包括（1）在各个生物传感器之间物理劣化/去除波导膜; （2）在各个生物传感器之间在波导膜内化学沉积高吸收材料; （3）在限定单个生物传感器的衍射光栅之间图形化无序（散射）区域; （4）使用特定掩模并沉积波导膜的各个贴片，其中每个贴片限定至少一个生物传感器。 这些方法和本文所描述的其它方法中的每一种都防止光在各个感测区域之间的传播，从而消除了生物传感器之间的光学串扰。 本发明还包括所得到的微孔板。

公开(公告)号：US20060223051A1

公开(公告)日：2006-10-05

申请号：US11100262

申请日：2005-04-05

申请人： Ye Fang ,  Ann Ferrie ,  Norman Fontaine ,  Joydeep Lahiri ,  Po Yuen

发明人： Ye Fang ,  Ann Ferrie ,  Norman Fontaine ,  Joydeep Lahiri ,  Po Yuen

IPC分类号： G01N33/53 ,  C12Q1/00

CPC分类号： G01N33/5041 ,  G01N21/4788 ,  G01N21/553 ,  G01N2333/726 ,  G01N2500/10

摘要： The present invention includes a system and method that uses optical LID biosensors to monitor in real time agonist-induced GPCR signaling events within living cells. Particularly, the present invention includes a system and method for using an optical LID biosensor to screen compounds against a target GPCR within living cells based on the mass redistribution due to agonist-induced GPCR activation. In an extended embodiment, the present invention discloses different ways for self-referencing the optical LID biosensor to eliminate unwanted sensitivity to ambient temperature, pressure fluctuations, and other environmental changes. In yet another extended embodiment, the present invention discloses different ways for screening multiple GPCRs in a single type of cell or multiple GPCRs in multiple types of cells within a single medium solution. In still yet another extended embodiment, the present invention discloses different ways to confirm the physiological or pharmacological effect of a compound against a specific GPCR within living cells.

摘要翻译： 本发明包括使用光学LID生物传感器实时监测活细胞内激动剂诱导的GPCR信号事件的系统和方法。 特别地，本发明包括使用光学LID生物传感器基于由于激动剂诱导的GPCR活化导致的质量再分布来筛选活细胞内的靶GPCR的化合物的系统和方法。 在扩展实施例中，本发明公开了用于自参考光学LID生物传感器以消除对环境温度，压力波动和其他环境变化的不期望的灵敏度的不同方式。 在又一个扩展的实施方案中，本发明公开了在单一培养基溶液中的多种类型的细胞中单种类型细胞或多种GPCR筛选多种GPCR的不同方式。 在又一个延伸的实施方案中，本发明公开了确定化合物对活细胞内特异性GPCR的生理或药理作用的不同方式。

公开(公告)号：US20060148101A1

公开(公告)日：2006-07-06

申请号：US11363400

申请日：2006-02-27

申请人： Ye Fang ,  Yulong Hong ,  Jinlin Peng

发明人： Ye Fang ,  Yulong Hong ,  Jinlin Peng

IPC分类号： G01N33/543

CPC分类号： G01N33/582 ,  C07K7/083 ,  C07K14/63 ,  G01N33/6845 ,  G01N33/74 ,  G01N2333/63 ,  G01N2333/726

摘要： Microarrays employing a fluorescent ligand including a material having a binding affinity in the range of about 0.01 to about 25 nM, or about 0.1 to about 10 nM; a specificity to its cognate receptor in the range of about 50 to about 99%, or about 65 to about 99%; a cross-activity to other receptors of 0 to about 20%, or 0 to about 10%; a net charge per ligand of about −3 to about +5, or more preferably, about −2 to about +2 or most preferably for small compound ligands about −1 to about +2. The ligand may also have a hydrophobicity in the range of about 3 to about 55 minutes eluting time (as measured under specified eluting conditions). In some embodiments, the ligand includes fluorescently labeled motilin 1-16 labeled with Bodipy-TMR, rhodamine or Cy5-. Other embodiments include fluorescently labeled Cy5-naltrexone, Cy5-neurotensin 2-13, N-terminal labeled neurotensin 2-13 or lys-labeled labeled neurotensin 2-13.

摘要翻译： 使用荧光配体的微阵列，其包括具有约0.01至约25nM或约0.1至约10nM范围内的结合亲和力的材料; 在约50至约99％，或约65至约99％的范围内对其同源受体的特异性; 与其他受体的交叉活性为0至约20％，或0至约10％; 每个配体的净电荷为约-3至约+5，或更优选约-2至约+2，或最优选约为-1至约+2的小化合物配体。 配体还可以具有约3至约55分钟洗脱时间（在规定的洗脱条件下测量）的疏水性。 在一些实施方案中，配体包括用Bodipy-TMR，罗丹明或Cy5-标记的荧光标记的胃动素1-16。 其他实施方案包括荧光标记的Cy5-纳曲酮，Cy5-神经丝氨酸2-13，N-末端标记的神经丝氨酸蛋白酶2-13或lys-标记的标记的神经丝氨酸素2-13。

公开(公告)号：US20050260685A1

公开(公告)日：2005-11-24

申请号：US11173974

申请日：2005-07-01

申请人： Ye Fang ,  Anthony Frutos ,  Steven Jonas ,  Peter Kalal ,  Joydeep Lahiri

发明人： Ye Fang ,  Anthony Frutos ,  Steven Jonas ,  Peter Kalal ,  Joydeep Lahiri

IPC分类号： G01N27/62 ,  B01J19/00 ,  C07K1/04 ,  C12M1/34 ,  C40B40/10 ,  C40B60/14 ,  G01N21/41 ,  G01N21/64 ,  G01N21/76 ,  G01N27/02 ,  G01N33/53 ,  G01N33/543 ,  G01N33/545 ,  G01N33/547 ,  G01N33/552 ,  G01N33/553 ,  G01N33/566 ,  G01N33/68 ,  G01N33/74 ,  G01N37/00

CPC分类号： B01J19/0046 ,  B01J2219/00385 ,  B01J2219/00387 ,  B01J2219/00497 ,  B01J2219/00527 ,  B01J2219/00576 ,  B01J2219/00585 ,  B01J2219/00596 ,  B01J2219/00605 ,  B01J2219/0061 ,  B01J2219/00612 ,  B01J2219/00617 ,  B01J2219/00619 ,  B01J2219/00626 ,  B01J2219/0063 ,  B01J2219/00637 ,  B01J2219/00659 ,  B01J2219/00662 ,  B01J2219/00689 ,  B01J2219/00691 ,  B01J2219/00707 ,  B01J2219/00725 ,  B01J2219/0074 ,  B82Y15/00 ,  B82Y30/00 ,  C07K1/047 ,  C40B40/10 ,  C40B60/14 ,  G01N33/5438 ,  G01N33/566 ,  G01N33/6845 ,  G01N33/6872 ,  G01N33/74 ,  G01N2333/726 ,  G01N2500/02

摘要： The present invention overcomes the problems and disadvantages associated with prior art arrays by providing an array comprising a plurality of biological membrane microspots associated with a surface of a substrate that can be produced, used and stored, not in an aqueous environment, but in an environment exposed to air under ambient or controlled humidities. Preferably, the biological membrane microspots comprise a membrane bound protein. Most preferably, the membrane bound protein is a G-protein coupled receptor, an ion channel, a receptor serine/threonine kinase or a receptor tyrosine kinase.

摘要翻译： 本发明克服了与现有技术阵列相关的问题和缺点，提供了一种阵列，其包括与基底表面相关联的多个生物膜微孔，该生物膜微孔可以在水溶液环境中生产，使用和储存，而不是在环境中 在环境或受控的湿度下暴露于空气。 优选地，生物膜微点包含膜结合蛋白。 最优选地，膜结合蛋白是G蛋白偶联受体，离子通道，受体丝氨酸/苏氨酸激酶或受体酪氨酸激酶。

公开(公告)号：US20050048648A1

公开(公告)日：2005-03-03

申请号：US10651554

申请日：2003-08-29

申请人： Ye Fang ,  Ann Ferrie

发明人： Ye Fang ,  Ann Ferrie

IPC分类号： C12N5/02

CPC分类号： C40B50/08 ,  C40B40/00 ,  G01N2333/726

摘要： A standardized, buffered solution or “ink” composition for re-formulating or suspending biological membranes used in the fabrication of membrane arrays. The composition can enhance assay performance and prolong the shelf life of biological membrane arrays. The ink composition comprises a combination of at least two of the following six classes of reagents: 1) a pH buffer reagent; 2) a monovalent or divalent, inorganic salt; 3) a membrane stabilizer; 4) a solution viscosity control reagent; 5) a water-soluble protein; or, 6) a protease inhibitor. A method for fabricating a membrane array using the present ink composition is also described.

摘要翻译： 用于重新配制或悬浮用于制造膜阵列的生物膜的标准化缓冲溶液或“油墨”组合物。 该组合物可以增强测定性能并延长生物膜阵列的保质期。 油墨组合物包含以下六类试剂中的至少两种的组合：1）pH缓冲剂; 2）一价或二价无机盐; 3）膜稳定剂; 4）溶液粘度控制试剂; 5）水溶性蛋白质; 或6）蛋白酶抑制剂。 还描述了使用本发明的油墨组合物制造膜阵列的方法。

公开(公告)号：US20120022116A1

公开(公告)日：2012-01-26

申请号：US13182019

申请日：2011-07-13

申请人： Huayun Deng ,  Ye Fang ,  Mingqian He ,  Haibei Hu ,  Weijun Niu ,  Haiyan Sun

发明人： Huayun Deng ,  Ye Fang ,  Mingqian He ,  Haibei Hu ,  Weijun Niu ,  Haiyan Sun

IPC分类号： A61K31/44 ,  C12Q1/02 ,  A61K31/341 ,  C07D495/04 ,  A61K31/381 ,  C07D333/40 ,  C07D409/04 ,  C07C229/56 ,  A61K31/196 ,  C07C229/58 ,  C07D213/74 ,  C07D307/66 ,  C07D333/36 ,  C07D207/34 ,  A61K31/40 ,  C07C255/42 ,  A61K31/277 ,  C40B30/06 ,  A61P29/00 ,  A61P3/10 ,  A61P9/06 ,  A61P3/00 ,  A61P9/00 ,  A61P35/00 ,  A61P3/06 ,  A61P3/04 ,  A61P9/10 ,  A61P9/12 ,  G01N21/64 ,  C07D307/68

CPC分类号： C07D207/34 ,  C07C229/56 ,  C07C229/58 ,  C07C255/34 ,  C07D213/74 ,  C07D307/52 ,  C07D307/66 ,  C07D333/16 ,  C07D333/20 ,  C07D333/22 ,  C07D333/36 ,  C07D333/38

摘要： Disclosed are compositions and methods for the prevention and/or treatment of diseases which are pathophysiologically related to GPR35, and/or GPR35-hERG signaling complex. For example, disclosed are compounds for preventing and/or treating diseases which are pathophysiologically related to GPR35 in a subject. The compounds having a formula (I), (II) or (III):

摘要翻译： 公开了用于预防和/或治疗与GPR35和/或GPR35-hERG信号传导复合物病理生理学相关的疾病的组合物和方法。 例如，公开了用于预防和/或治疗受试者与病理生理学上与GPR35相关的疾病的化合物。 具有式（I），（II）或（III）的化合物：

公开(公告)号：US20100129908A1

公开(公告)日：2010-05-27

申请号：US12622079

申请日：2009-11-19

申请人： Ye Fang ,  Yi-Cheng Hsieh ,  Ling Huang ,  Ying Wei

发明人： Ye Fang ,  Yi-Cheng Hsieh ,  Ling Huang ,  Ying Wei

IPC分类号： C12N5/071

CPC分类号： C12N5/067 ,  C12M25/02 ,  C12N2502/13 ,  C12N2533/54

摘要： An article for culturing cells includes a substrate on which cells can be cultured. The substrate has a base surface. An array of projections extends from the base surface. The projections have a height of about 1 micrometer to about 100 micrometers, and have a gap distance along the major surface from center to center between neighboring projections of about 10 micrometers to 80 micrometers. A plurality of arrays of projections may extend from the surface with gaps in the base surface between the arrays. Hepatocytes cultures on such microprojection array substrates maintained in vivo like morphology and membrane polarity. Hepatocytes co-cultured with helper cells on such substrates tended to grow in the area of the arrays, while the helper cells tended to grow in the areas between the arrays.

摘要翻译： 培养细胞的制品包括可以培养细胞的底物。 基板具有基面。 一组突起从基面延伸出来。 突起具有约1微米至约100微米的高度，并且在约10微米至80微米的相邻突起之间具有从中心到中心的主表面的间隙距离。 多个突起阵列可以从阵列之间的基部表面中的间隙从表面延伸。 在这样的微喷射阵列基板上的肝细胞培养物保持体内，如形态和膜极性。 与这种底物上的辅助细胞共培养的肝细胞趋向于在阵列区域中生长，而辅助细胞趋向于在阵列之间的区域中生长。

公开(公告)号：US20090215650A1

公开(公告)日：2009-08-27

申请号：US12437893

申请日：2009-05-08

申请人： Ye Fang ,  Anthony G. Frutos ,  Joydeep Lahiri

发明人： Ye Fang ,  Anthony G. Frutos ,  Joydeep Lahiri

IPC分类号： C40B40/10

CPC分类号： G01N33/54393 ,  B01J19/0046 ,  B01J2219/00385 ,  B01J2219/00527 ,  B01J2219/00605 ,  B01J2219/0061 ,  B01J2219/00612 ,  B01J2219/00626 ,  B01J2219/0063 ,  B01J2219/00635 ,  B01J2219/00659 ,  B01J2219/0074 ,  C40B60/14 ,  G01N33/54366

摘要： The present invention provides a method for preparing a physically stable array of biological membranes, including membrane proteins, on a surface, and the resultant article of manufacture. The method comprises providing a substrate; creating either a polar surface or reactive surface by coating the substrate with a material that either: (1) enhances the stability of lipid spots during withdrawing through a water/air interface and washing and drying protocols; or (2) gives rise to minimal non-specific binding of a labeled target to a background surface, and high specific binding to a probe receptor in said membrane array, or (3) both; and depositing an array of biological-membrane microspots on the substrate. The method may further comprise applying a reagent that includes a soluable protein to stabilize the biological membranes on the surface. Also provided is an article having biological-membrane microspots that are associated in a stable fashion with a substrate surface embodying these properties.

摘要翻译： 本发明提供了一种在表面上制备物理上稳定的生物膜阵列，包括膜蛋白的方法，以及所得制品。 该方法包括提供基底; 通过用以下材料涂覆基材来产生极性表面或反应性表面：（1）在通过水/空气界面排出并洗涤和干燥方案期间提高脂质斑点的稳定性; 或（2）导致标记的靶与背景表面的最小非特异性结合，以及所述膜阵列中与探针受体的高特异性结合，或（3）两者; 以及在衬底上沉积生物膜微点阵列。 该方法还可以包括施加包含可溶蛋白质的试剂以稳定表面上的生物膜。 还提供了具有生物膜微点的物品，其以稳定的方式与体现这些性质的基底表面相关联。

公开(公告)号：US20090181409A1

公开(公告)日：2009-07-16

申请号：US12008309

申请日：2008-01-10

申请人： Ye Fang ,  Guangshan Li

发明人： Ye Fang ,  Guangshan Li

IPC分类号： G01N33/53

CPC分类号： G01N33/54373 ,  G01N33/5008 ,  G01N33/554

摘要： An apparatus and non-invasive method to measure cell-cell interactions, such as T-cell and stem cell interactions, under physiologically relevant conditions, and optionally measure the effects of stimuli on the cell-cell interactions, as defined herein.

摘要翻译： 在生理学相关条件下测量细胞 - 细胞相互作用（诸如T细胞和干细胞相互作用）的装置和非侵入性方法，并且任选地测量刺激对如本文所定义的细胞 - 细胞相互作用的影响。