公开(公告)号：US20130303399A1

公开(公告)日：2013-11-14

申请号：US13977166

申请日：2011-12-28

申请人： Jay M. Short

发明人： Jay M. Short

IPC分类号： C07K16/46

CPC分类号： C07K16/461 ,  C07K16/248 ,  C07K16/464 ,  C07K2317/14 ,  C07K2317/24 ,  C07K2317/51 ,  C07K2317/515 ,  C07K2317/92

摘要： The disclosure provides a method for generation of humanized full length antibodies in mammalian cells. A library of humanized variants is provided with high, validated human framework diversity without requiring back-mutations to retain original affinity. Synthetic CDR encoding fragment libraries derived from a template antibody are ligated to human framework region encoding fragments from a human framework pool limited only to germline sequences from a functionally expressed anti-Combine bodies. The vector comprises a nucleic acid sequence encoding HC framework region 4. No CDR grafting or phage display is required.

摘要翻译： 本公开提供了在哺乳动物细胞中产生人源化全长抗体的方法。 人源化变体的文库提供了高度有效的人类框架多样性，而不需要反向突变保留原始亲和力。 将衍生自模板抗体的合成CDR编码片段文库与编码来自功能性表达的抗联合体的种系序列的人框架库的编码片段的人框架区连接。 载体包含编码HC框架区4的核酸序列。不需要CDR移植或噬菌体展示。

公开(公告)号：US20130116125A1

公开(公告)日：2013-05-09

申请号：US13810601

申请日：2011-03-04

申请人： Jay M. Short

发明人： Jay M. Short

IPC分类号： C07K1/107

CPC分类号： C07K1/107 ,  C07K1/047 ,  C12N15/1058 ,  C40B30/04 ,  G01N33/6845 ,  G06F19/18

摘要： The present invention is relevant to proteins and novel methods of protein evolution. The present invention further relates to methods of identifying and mapping mutant polypeptides formed from, or based upon, a template polypeptide.

摘要翻译： 本发明涉及蛋白质和蛋白质进化的新方法。 本发明还涉及鉴定和鉴定由模板多肽形成或基于模板多肽的突变多肽的方法。

公开(公告)号：US08318471B2

公开(公告)日：2012-11-27

申请号：US13236862

申请日：2011-09-20

申请人： Grace Desantis ,  Jay M. Short ,  Mark J. Burk ,  Kelvin Wong ,  Robert Farwell ,  Kelly Chatman

发明人： Grace Desantis ,  Jay M. Short ,  Mark J. Burk ,  Kelvin Wong ,  Robert Farwell ,  Kelly Chatman

IPC分类号： C12N9/78 ,  C12N15/00 ,  C12N1/20 ,  C12P21/04 ,  C12P21/06 ,  C12Q1/00 ,  C12Q1/68 ,  C07H21/04

CPC分类号： C12N9/78 ,  C12N15/00 ,  C12P7/42 ,  C12P13/002 ,  C12P13/04 ,  C12P41/006 ,  C12Y305/05001 ,  Y02P20/52

摘要： The invention relates to nitrilases and to nucleic acids encoding the nitrilases. In addition methods of designing new nitrilases and method of use thereof are also provided. The nitrilases have increased activity and stability at increased pH and temperature.

公开(公告)号：US08088613B2

公开(公告)日：2012-01-03

申请号：US12773317

申请日：2010-05-04

申请人： Mark Burk ,  Kelly Chatman ,  Grace Desantis ,  Bob Farwell ,  Jay M. Short ,  Kelvin Wong

发明人： Mark Burk ,  Kelly Chatman ,  Grace Desantis ,  Bob Farwell ,  Jay M. Short ,  Kelvin Wong

IPC分类号： C12N9/78 ,  C12N15/00 ,  C12N1/20 ,  C12P21/04 ,  C12Q1/00 ,  C07H21/04

CPC分类号： C12N9/78 ,  C12N15/00 ,  C12P7/42 ,  C12P13/002 ,  C12P13/04 ,  C12P41/006 ,  C12Y305/05001 ,  Y02P20/52

摘要： The invention relates to nitrilases and to nucleic acids encoding the nitrilases. In addition methods of designing new nitrilases and method of use thereof are also provided. The nitrilases have increased activity and stability at increased pH and temperature.

摘要翻译： 本发明涉及腈水解酶和编码腈水解酶的核酸。 另外还提​​供了设计新腈水解酶的方法及其使用方法。 在增加的pH和温度下，腈水解酶具有增加的活性和稳定性。

公开(公告)号：US07824895B2

公开(公告)日：2010-11-02

申请号：US11933174

申请日：2007-10-31

申请人： Jay M. Short ,  Kevin A. Gray ,  Nelson R. Barton ,  James B. Garrett ,  Eileen O'Donoghue ,  Dan E. Robertson

发明人： Jay M. Short ,  Kevin A. Gray ,  Nelson R. Barton ,  James B. Garrett ,  Eileen O'Donoghue ,  Dan E. Robertson

IPC分类号： C07H21/00 ,  C12N15/00 ,  C12N5/10 ,  C12N1/21 ,  C12P21/00 ,  C12N9/16 ,  C07K14/00 ,  C12Q1/68 ,  C12Q1/44

CPC分类号： A21D8/042 ,  A01K2217/05 ,  A23J3/14 ,  A23K10/30 ,  A23K20/189 ,  A23L5/25 ,  A23L7/107 ,  A23L11/33 ,  A23L29/06 ,  A23V2002/00 ,  A61K38/00 ,  C12N9/16 ,  C12Y301/03008 ,  C12Y301/03026 ,  A23V2300/21

摘要： The invention provides isolated and recombinant phytase enzymes. In one aspect, the phytases are produced by modification of the wild type appA of E. coli. The enzyme can be produced from recombinant host cells. The phytases of the invention can be used to aid in the digestion of phytate where desired. In particular, the phytases of the invention can be used in foodstuffs to improve the feeding value of phytate rich ingredients. The phytases of the invention can be thermotolerant and/or thermostable. Also provided are methods for obtaining a variant polynucleotide encoding a phytase and for obtaining a phytase with thermostability or thermotolerant at high or low temperatures.

摘要翻译： 本发明提供了分离和重组的植酸酶。 一方面，通过修饰大肠杆菌的野生型appA产生植酸酶。 该酶可以从重组宿主细胞产生。 本发明的植酸酶可以用于有助于在需要时消化植酸盐。 特别地，本发明的植酸酶可用于食品中以改善富含植酸盐的成分的摄食量。 本发明的植酸酶可以是耐热和/或耐热的。 还提供了获得编码植酸酶的变体多核苷酸和在高温或低温下获得具有热稳定性或耐热性的植酸酶的方法。

公开(公告)号：US20100260739A1

公开(公告)日：2010-10-14

申请号：US12719972

申请日：2010-03-09

申请人： Jay M. Short ,  Hwai Wen Chang ,  Gerhard Frey

发明人： Jay M. Short ,  Hwai Wen Chang ,  Gerhard Frey

IPC分类号： A61K38/45 ,  C12P21/06 ,  C12N9/12 ,  C12N9/26 ,  C07K14/00 ,  A61K38/46 ,  A61K38/00 ,  G01N33/53

CPC分类号： C12N15/102 ,  A61K38/00 ,  C07K7/06 ,  C07K14/3153 ,  C07K14/47 ,  C07K14/575 ,  C07K14/57545 ,  C07K14/57563 ,  C12N9/16 ,  C12N9/50 ,  C12N9/6435 ,  C12N9/6459 ,  C12N9/6462 ,  C12N15/1058 ,  C12Y302/01035 ,  C12Y304/21007 ,  C12Y304/21069 ,  C12Y304/21073 ,  C12Y304/23015 ,  C12Y304/24029 ,  G01N33/54306 ,  G01N33/573 ,  G01N33/6845 ,  G01N33/6854 ,  Y02A50/473

摘要： This disclosure relates to a method of generating conditionally active biologic proteins from wild type proteins, in particular therapeutic proteins, which are reversibly or irreversibly inactivated at the wild type normal physiological conditions. For example, evolved proteins are virtually inactive at body temperature, but are active at lower temperatures.

摘要翻译： 本公开涉及从野生型正常生理条件下可逆地或不可逆地灭活的野生型蛋白质，特别是治疗性蛋白质产生条件活性生物蛋白质的方法。 例如，进化蛋白质在体温实际上是无活性的，但在较低温度下是活性的。

公开(公告)号：US20100221779A1

公开(公告)日：2010-09-02

申请号：US12778854

申请日：2010-05-12

申请人： JAY M. SHORT ,  KEVIN A. GRAY ,  NELSON R. BARTON ,  JAMES B. GARRETT ,  EILEEN O'DONOGHUE ,  DAN E. ROBERTSON

发明人： JAY M. SHORT ,  KEVIN A. GRAY ,  NELSON R. BARTON ,  JAMES B. GARRETT ,  EILEEN O'DONOGHUE ,  DAN E. ROBERTSON

IPC分类号： C12P21/02 ,  C07H21/04 ,  C12N15/74 ,  C12N5/10 ,  C12N1/21 ,  C12N1/19 ,  C12N9/14 ,  C07K14/00

CPC分类号： A21D8/042 ,  A01K2217/05 ,  A23J3/14 ,  A23K10/30 ,  A23K20/189 ,  A23L5/25 ,  A23L7/107 ,  A23L11/33 ,  A23L29/06 ,  A23V2002/00 ,  A61K38/00 ,  C12N9/16 ,  C12Y301/03008 ,  C12Y301/03026 ,  A23V2300/21

摘要： The invention provides isolated and recombinant phytase enzymes. In one aspect, the phytases are produced by modification of the wild type appA of E. coli. The enzyme can be produced from recombinant host cells. The phytases of the invention can be used to aid in the digestion of phytate where desired. In particular, the phytases of the invention can be used in foodstuffs to improve the feeding value of phytate rich ingredients. The phytases of the invention can be thermotolerant and/or thermostable. Also provided are methods for obtaining a variant polynucleotide encoding a phytase and for obtaining a phytase with thermostability or thermotolerant at high or low temperatures.

摘要翻译： 本发明提供了分离和重组的植酸酶。 一方面，通过修饰大肠杆菌的野生型appA产生植酸酶。 该酶可以从重组宿主细胞产生。 本发明的植酸酶可以用于有助于在需要时消化植酸盐。 特别地，本发明的植酸酶可用于食品中以改善富含植酸盐的成分的摄食量。 本发明的植酸酶可以是耐热和/或耐热的。 还提供了获得编码植酸酶的变体多核苷酸和在高温或低温下获得具有热稳定性或耐热性的植酸酶的方法。

公开(公告)号：US20100086986A1

公开(公告)日：2010-04-08

申请号：US12629818

申请日：2009-12-02

申请人： Grace DESANTIS ,  Jennifer Ann CHAPLIN ,  Ellen CHI ,  Aileen MILAN ,  Jay M. SHORT ,  David WEINER ,  Mark MADDEN ,  Darcy MADDEN ,  Mark J. BURK ,  Dan E. ROBERTSON

发明人： Grace DESANTIS ,  Jennifer Ann CHAPLIN ,  Ellen CHI ,  Aileen MILAN ,  Jay M. SHORT ,  David WEINER ,  Mark MADDEN ,  Darcy MADDEN ,  Mark J. BURK ,  Dan E. ROBERTSON

IPC分类号： C12N9/78 ,  C07H21/04

CPC分类号： C12P7/42 ,  C12N9/78 ,  C12N15/00 ,  C12N15/70 ,  C12N15/74 ,  C12N15/81 ,  C12N15/815 ,  C12P7/40 ,  C12P13/004 ,  C12P13/04 ,  C12P21/00 ,  C12P41/006

摘要： The invention relates to nitrilases and to nucleic acids encoding the nitrilases. In addition methods of designing new nitrilases and method of use thereof are also provided. The nitrilases have increased activity and stability at increased pH and temperature.

摘要翻译： 本发明涉及腈水解酶和编码腈水解酶的核酸。 另外还提​​供了设计新腈水解酶的方法及其使用方法。 在增加的pH和温度下，腈水解酶具有增加的活性和稳定性。

公开(公告)号：US20100047392A1

公开(公告)日：2010-02-25

申请号：US12567550

申请日：2009-09-25

申请人： Walter Callen ,  Toby Richardson ,  Gerhard Frey ,  Jay M. Short ,  Eric J. Mathur ,  Kevin A. Gray ,  Janne S. Kerovuo ,  Malgorzata Slupska

发明人： Walter Callen ,  Toby Richardson ,  Gerhard Frey ,  Jay M. Short ,  Eric J. Mathur ,  Kevin A. Gray ,  Janne S. Kerovuo ,  Malgorzata Slupska

IPC分类号： C12N9/26 ,  C12P19/14 ,  C11D3/386 ,  D06M16/00 ,  C13K1/06 ,  C09K8/20 ,  D21C5/02

CPC分类号： C12N9/2417 ,  A21D8/042 ,  C12N9/2414 ,  C12P19/04 ,  C12P19/14 ,  C12Y302/01001 ,  Y02E50/16 ,  Y02E50/17

摘要： The invention relates to alpha amylases and to polynucleotides and polypeptides encoding the alpha amylases. In addition, methods of using the alpha amylases are also provided. The alpha amylases have increased activity and stability at acidic, neutral and alkaline pH and at increased temperatures.

摘要翻译： 本发明涉及α-淀粉酶和编码α-淀粉酶的多核苷酸和多肽。 此外，还提供了使用α-淀粉酶的方法。 在酸性，中性和碱性pH和升高的温度下，α-淀粉酶具有增加的活性和稳定性。

公开(公告)号：US07651849B2

公开(公告)日：2010-01-26

申请号：US12397204

申请日：2009-03-03

申请人： Grace DeSantis ,  Ellen Chi ,  Jennifer Ann Chaplin ,  Aileen Milan ,  Jay M. Short ,  David Paul Weiner ,  Mark Madden ,  Darcy Madden, legal representative ,  Mark J. Burk ,  Dan E. Robertson

发明人： Grace DeSantis ,  Ellen Chi ,  Jennifer Ann Chaplin ,  Aileen Milan ,  Jay M. Short ,  David Paul Weiner ,  Mark Madden ,  Mark J. Burk ,  Dan E. Robertson

IPC分类号： C12N9/78 ,  C12N15/00 ,  C12N1/20 ,  C12P21/04 ,  C12Q1/00 ,  A61K38/00 ,  C07H21/04 ,  C12Q1/68 ,  C07H21/02

CPC分类号： C12P7/42 ,  C12N9/78 ,  C12N15/00 ,  C12N15/70 ,  C12N15/74 ,  C12N15/81 ,  C12N15/815 ,  C12P7/40 ,  C12P13/004 ,  C12P13/04 ,  C12P21/00 ,  C12P41/006

摘要： The invention relates to nitrilases and to nucleic acids encoding the nitrilases. In addition methods of designing new nitrilases and method of use thereof are also provided. The nitrilases have increased activity and stability at increased pH and temperature.

摘要翻译： 本发明涉及腈水解酶和编码腈水解酶的核酸。 另外还提​​供了设计新腈水解酶的方法及其使用方法。 在增加的pH和温度下，腈水解酶具有增加的活性和稳定性。