公开(公告)号：US08329438B2

公开(公告)日：2012-12-11

申请号：US12646907

申请日：2009-12-23

申请人： Christopher Savile ,  Vesna Mitchell ,  Xiyun Zhang ,  Gjalt Huisman

发明人： Christopher Savile ,  Vesna Mitchell ,  Xiyun Zhang ,  Gjalt Huisman

IPC分类号： C12N9/02

CPC分类号： C12N9/001 ,  C07K2319/00 ,  C12N9/0036 ,  C12N15/00 ,  C12P7/24 ,  C12P7/26 ,  C12P7/52 ,  C12P7/62 ,  C12P13/002 ,  C12Y103/01031 ,  C12Y106/99001 ,  Y02P20/52

摘要： The disclosure relates to engineered enone reductase polypeptides having improved properties, polynucleotides encoding the engineered polypeptides, related vectors, host cells, and methods for making the engineered enone reductase polypeptides. The disclosure also provides methods of using the engineered enone reductase polypeptides for chemical transformations.

摘要翻译： 本公开涉及具有改进性质的工程化烯酮还原酶多肽，编码工程改造多肽的多核苷酸，相关载体，宿主细胞和用于制备工程化烯酮还原酶多肽的方法。 本公开还提供了使用工程化烯酮还原酶多肽进行化学转化的方法。

公开(公告)号：US20100190218A1

公开(公告)日：2010-07-29

申请号：US12646907

申请日：2009-12-23

申请人： Christopher Savile ,  Vesna Mitchell ,  Xiyun Zhang ,  Gjalt Huisman

发明人： Christopher Savile ,  Vesna Mitchell ,  Xiyun Zhang ,  Gjalt Huisman

IPC分类号： C12P13/00 ,  C12N9/00 ,  C12N15/52 ,  C12N15/63 ,  C12N1/00 ,  C12P7/26 ,  C12P7/24 ,  C12P7/62

CPC分类号： C12N9/001 ,  C07K2319/00 ,  C12N9/0036 ,  C12N15/00 ,  C12P7/24 ,  C12P7/26 ,  C12P7/52 ,  C12P7/62 ,  C12P13/002 ,  C12Y103/01031 ,  C12Y106/99001 ,  Y02P20/52

摘要： The disclosure relates to engineered enone reductase polypeptides having improved properties, polynucleotides encoding the engineered polypeptides, related vectors, host cells, and methods for making the engineered enone reductase polypeptides. The disclosure also provides methods of using the engineered enone reductase polypeptides for chemical transformations.

摘要翻译： 本公开涉及具有改进性质的工程化烯酮还原酶多肽，编码工程改造多肽的多核苷酸，相关载体，宿主细胞和用于制备工程化烯酮还原酶多肽的方法。 本公开还提供了使用工程化烯酮还原酶多肽进行化学转化的方法。

公开(公告)号：US20130052713A1

公开(公告)日：2013-02-28

申请号：US13592024

申请日：2012-08-22

申请人： Jie Yang ,  Xiyun Zhang ,  Jungjoo Yoon ,  Kripa Rao ,  John H. Grate ,  David Elgart ,  Dipnath Baidyaroy

发明人： Jie Yang ,  Xiyun Zhang ,  Jungjoo Yoon ,  Kripa Rao ,  John H. Grate ,  David Elgart ,  Dipnath Baidyaroy

IPC分类号： C12N9/42 ,  C12N15/80 ,  C12N1/15 ,  C12N9/96 ,  C12N9/26 ,  C12N9/34 ,  C12N9/16 ,  C12N9/20 ,  C12N15/56 ,  C12N1/19

CPC分类号： C12N9/2434 ,  C12N9/242 ,  C12N9/2437 ,  C12N9/2445 ,  C12P7/10 ,  C12P19/14 ,  C12Y302/01004 ,  C12Y302/01021 ,  C12Y302/01091 ,  Y02E50/16

摘要： The present invention provides various GH61 protein variants comprising various amino acid substitutions. The GH61 protein variants have an improved ability to synergize with cellulase enzymes, thereby increasing the yield of fermentable sugars obtained by saccharification of biomass. In some embodiments, sugars obtained from saccharification are fermented to produce numerous end-products, including but not limited to alcohol.

公开(公告)号：US20120009631A1

公开(公告)日：2012-01-12

申请号：US13203909

申请日：2010-03-10

申请人： Jie Yang ,  Xiyun Zhang ,  Ish Kumar Dhawan ,  Andrew Shaw

发明人： Jie Yang ,  Xiyun Zhang ,  Ish Kumar Dhawan ,  Andrew Shaw

IPC分类号： C12P19/12 ,  C07H21/00 ,  C12N15/63 ,  C12P7/14 ,  C12P19/02 ,  C12P19/00 ,  C12P7/02 ,  C12N9/42 ,  C12N1/21

CPC分类号： C12N9/2408 ,  C12N9/2437 ,  C12P7/10 ,  C12P19/12 ,  C12P19/14 ,  C12Y302/01004 ,  C12Y302/01091 ,  Y02E50/16 ,  Y02E50/17 ,  Y02P20/52

摘要： The invention provides variants of the Clostridium thermocellum endoglucanase (CeIG) that have improved endoglucanase activity compared to the wild type enzyme. Also provided are related polynucleotides, compositions, vectors, host cells, and methods of use.

摘要翻译： 本发明提供了与野生型酶相比具有改善的内切葡聚糖酶活性的热梭菌内切葡聚糖酶（CeIG）的变体。 还提供了相关多核苷酸，组合物，载体，宿主细胞和使用方法。

公开(公告)号：US09005946B2

公开(公告)日：2015-04-14

申请号：US13203909

申请日：2010-03-10

申请人： Jie Yang ,  Xiyun Zhang ,  Ish Kumar Dhawan ,  Andrew Shaw

发明人： Jie Yang ,  Xiyun Zhang ,  Ish Kumar Dhawan ,  Andrew Shaw

IPC分类号： C12P7/10 ,  C12P19/12 ,  C12P19/14 ,  C12N9/42

CPC分类号： C12N9/2408 ,  C12N9/2437 ,  C12P7/10 ,  C12P19/12 ,  C12P19/14 ,  C12Y302/01004 ,  C12Y302/01091 ,  Y02E50/16 ,  Y02E50/17 ,  Y02P20/52

摘要： The invention provides variants of the Clostridium thermocellum endoglucanase (CelG) that have improved endoglucanase activity compared to the wild type enzyme. Also provided are related polynucleotides, compositions, vectors, host cells, and methods of use.

摘要翻译： 本发明提供了与野生型酶相比具有改善的内切葡聚糖酶活性的热梭菌内切葡聚糖酶（CelG）的变体。 还提供了相关多核苷酸，组合物，载体，宿主细胞和使用方法。

公开(公告)号：US08685690B2

公开(公告)日：2014-04-01

申请号：US13416608

申请日：2012-03-09

申请人： Jie Yang ,  Xiyun Zhang ,  Attila Andor

发明人： Jie Yang ,  Xiyun Zhang ,  Attila Andor

IPC分类号： C12N9/42 ,  C12P19/02 ,  C12P19/00

CPC分类号： C12N9/42 ,  C12N9/2434 ,  C12N9/2445 ,  C12P7/10 ,  C12P19/02 ,  C12P19/14 ,  C12Y302/01021 ,  Y02E50/16

摘要： The invention relates to recombinant expression of a variant form of a fungal C1 strain β-glucosidase. The invention also relates to the generation of fermentable sugars from biomass and the production of biofuels by fermentation of the sugars using genetically modified organisms expressing the β-glucosidase variant. The invention provides methods for producing a fermentable sugar, such as glucose, from cellobiose by contacting cellobiose with a recombinant β-glucosidase variant protein, such as a variant protein secreted by a recombinant host cell into culture medium. Methods of the invention may be used for conversion of a biomass substrate to a fermentable sugar, and ultimately to ethanol or other biofuel.

摘要翻译： 本发明涉及真菌C1菌株和葡萄糖苷酶的变体形式的重组表达。 本发明还涉及通过使用表达“葡糖苷酶”变体的转基因生物体从生物质产生可发酵糖并通过发酵糖生产生物燃料。 本发明提供了通过将纤维二糖与重组体 - 葡糖苷酶变体蛋白（例如由重组宿主细胞分泌的变体蛋白）接触到培养基中来从纤维二糖生产可发酵糖例如葡萄糖的方法。 本发明的方法可用于将生物质底物转化为可发酵的糖，最终转化为乙醇或其他生物燃料。

公开(公告)号：US20120276594A1

公开(公告)日：2012-11-01

申请号：US13459038

申请日：2012-04-27

申请人： Rama Voladri ,  Xiyun Zhang ,  Sachin Patil ,  David Elgart ,  Gregory Miller ,  Louis Clark ,  Kui Chan

发明人： Rama Voladri ,  Xiyun Zhang ,  Sachin Patil ,  David Elgart ,  Gregory Miller ,  Louis Clark ,  Kui Chan

IPC分类号： C12N9/42 ,  C12N1/19 ,  C12N1/15 ,  C12P19/14 ,  C12P7/14 ,  C12P7/16 ,  C12P7/48 ,  C12P7/54 ,  C12P7/56 ,  C12P7/58 ,  C12P7/46 ,  C12P7/20 ,  C12P7/18 ,  C12P13/14 ,  C12N15/56 ,  C12N15/80

CPC分类号： C12N9/2437 ,  C12N9/2434 ,  C12P19/02 ,  C12P19/14

摘要： The present invention relates to cellobiohydrolase variants having improved thermostability and/or thermoactivity in comparison to wild-type Myceliophthora thermophila CBH2b.

摘要翻译： 本发明涉及与野生型嗜热丝孢杆菌CBH2b相比具有改善的热稳定性和/或热活性的纤维二糖水解酶变体。

公开(公告)号：US20100063300A1

公开(公告)日：2010-03-11

申请号：US12490190

申请日：2009-06-23

申请人： Benjamin Mijts ,  Sheela Muley ,  Jack Liang ,  Lisa M. Newman ,  Xiyun Zhang ,  James Lalonde ,  Michael D. Clay ,  Jun Zhu ,  John M. Gruber ,  Jeffrey Colbeck ,  John D. Munger, JR. ,  Jagadeesh Mavinahalli ,  Roger Sheldon

发明人： Benjamin Mijts ,  Sheela Muley ,  Jack Liang ,  Lisa M. Newman ,  Xiyun Zhang ,  James Lalonde ,  Michael D. Clay ,  Jun Zhu ,  John M. Gruber ,  Jeffrey Colbeck ,  John D. Munger, JR. ,  Jagadeesh Mavinahalli ,  Roger Sheldon

IPC分类号： C07D209/52

CPC分类号： C07D403/04 ,  C07D209/02 ,  C07D403/12 ,  C07D487/04 ,  C12P13/24 ,  C12P17/10 ,  C12P17/188 ,  C12Y104/03004

摘要： The present disclosure provides substantially enantiomerically pure heterobicyclic compounds of the following structural formulas, wherein A, M, M′, and R5 are as described herein, and to biocatalytic processes for their preparation, and to the enzymes used in those processes.

摘要翻译： 本公开提供了基本上对映体纯的以下结构式的杂双环化合物，其中A，M，M'和R 5如本文所述，以及其制备的生物催化方法，以及用于这些方法的酶。

公开(公告)号：US08986965B2

公开(公告)日：2015-03-24

申请号：US13578525

申请日：2011-03-30

申请人： Robert McDaniel ,  Galit Meshulam-Simon ,  Oscar Alvizo ,  Xiyun Zhang

发明人： Robert McDaniel ,  Galit Meshulam-Simon ,  Oscar Alvizo ,  Xiyun Zhang

IPC分类号： C12P7/22 ,  C12P5/00 ,  C12N9/10 ,  C12N9/88

CPC分类号： C12P5/007 ,  C12N9/1085 ,  C12N9/88

摘要： The present invention relates to methods for producing monoterpenes, particularly tricyclene, by culturing microbial organisms that express a terpene synthase and optionally a prenyl transferase.

摘要翻译： 本发明涉及通过培养表达萜烯合酶和任选的异戊二烯基转移酶的微生物生物来生产单萜，特别是三环烯的方法。

公开(公告)号：US08945903B2

公开(公告)日：2015-02-03

申请号：US13549300

申请日：2012-07-13

申请人： Dipnath Baidyaroy ,  Louis Clark ,  David Elgart ,  Rama Voladri ,  Xiyun Zhang

发明人： Dipnath Baidyaroy ,  Louis Clark ,  David Elgart ,  Rama Voladri ,  Xiyun Zhang

IPC分类号： C12N9/42 ,  C12P19/14 ,  C12N15/80 ,  C12P7/14 ,  C12P7/16 ,  C12P7/18 ,  C12P7/20 ,  C12P7/46 ,  C12P7/48 ,  C12P7/54 ,  C12P7/56 ,  C12P7/58 ,  C12P13/14

CPC分类号： C12N9/2437 ,  C12N15/80 ,  C12P7/14 ,  C12P7/16 ,  C12P7/18 ,  C12P7/20 ,  C12P7/46 ,  C12P7/48 ,  C12P7/54 ,  C12P7/56 ,  C12P7/58 ,  C12P13/14 ,  C12P19/02 ,  C12P19/14 ,  C12Y302/01091 ,  Y02E50/16

摘要： The present invention relates to cellobiohydrolase variants having improved thermostability in comparison to wild-type CBH2a.

摘要翻译： 本发明涉及与野生型CBH2a相比具有改善的热稳定性的纤维二糖水解酶变体。