公开(公告)号：US20050095661A1

公开(公告)日：2005-05-05

申请号：US10479843

申请日：2002-06-07

申请人： Christian Hamon ,  Andrew Thompson ,  Thomas Neumann ,  Robert Johnstone ,  Abdul Karim Mohammed

发明人： Christian Hamon ,  Andrew Thompson ,  Thomas Neumann ,  Robert Johnstone ,  Abdul Karim Mohammed

IPC分类号： G01N27/62 ,  C07K1/12 ,  G01N30/88 ,  G01N33/483 ,  G01N33/68 ,  C12Q1/37

CPC分类号： G01N33/6848 ,  C07K1/12 ,  G01N33/6821

摘要： Provided is a method for characterising a polypeptide, which method comprises the steps of; (a) optionnally reducing cysteine disulphide bridges in the polypeptide to form free thiols, and capping the free thiols; (b) cleaving the polypeptide with a sequence specific cleavage reagent to form peptide fragments; (c) optionally deactivating the cleavage reagent; (d) capping one or more ε-amino groups that are present with a lysine reactive agent; (e) analysing peptide fragments by mass spectrometry to form a mass fingerprint for the polypeptide; and (f) determining the identity of the polypeptide from the mass fingerprint.

摘要翻译： 提供一种表征多肽的方法，该方法包括以下步骤： （a）选择性地减少多肽中的半胱氨酸二硫桥以形成游离的硫醇，并且封端游离的硫醇; （b）用序列特异性切割试剂切割多肽以形成肽片段; （c）任选地使切割试剂失活; （d）封端与赖氨酸反应剂一起存在的一个或多个ε-氨基; （e）通过质谱分析肽片段以形成多肽的质量指纹图谱; 和（f）从质量指纹图谱确定多肽的身份。

公开(公告)号：US20050048489A1

公开(公告)日：2005-03-03

申请号：US10489341

申请日：2002-09-16

申请人： Andrew Thompson ,  Christian Hamon ,  Jurgen Schafer ,  Karsten Kuhn ,  Joseph Schwarz ,  Thomas Neumann

发明人： Andrew Thompson ,  Christian Hamon ,  Jurgen Schafer ,  Karsten Kuhn ,  Joseph Schwarz ,  Thomas Neumann

IPC分类号： G01N27/62 ,  B01J20/281 ,  G01N30/04 ,  G01N30/72 ,  G01N30/88 ,  G01N33/48 ,  G01N33/483 ,  G01N33/50 ,  G01N33/53 ,  G01N33/58 ,  G01N33/68 ,  H01J49/04 ,  C12Q1/68 ,  C07H21/04

CPC分类号： G01N33/6848 ,  G01N33/68 ,  G01N33/6851 ,  G01N2458/15 ,  H01J49/04

摘要： Provided is a set of two or more mass labels, each label in the set comprising a mass marker moiety attached via a cleavable linker having at least one amide bond to a mass normalisation moiety, wherein the aggregate mass of each label in the set may be the same or different and the mass of the mass marker moiety of each label in the set may be the same or different, and wherein in any group of labels within the set having a mass marker moiety of a common mass each label has an aggregate mass different from all other labels in that group, and wherein in any group of labels within the set having a common aggregate mass each label has a mass marker moiety having a mass different from that of all other mass marker moieties in that group, such that all of the mass labels in the set are distinguishable from each other by mass spectromety, and wherein the mass marker moiety comprises an amino acid and the mass normalisation moiety comprises an amino acid.

摘要翻译： 提供了一组两个或更多个质量标签，该组中的每个标签包含通过具有至少一个酰胺键与质量标准化部分连接的质量标记部分，其中该组中每个标签的总质量可以是 相同或不同，组中每个标记物的质量标记物部分的质量可以相同或不同，并且其中在具有共同质量的质量标记物部分的组中的任何标签组中，每个标签具有总体质量 不同于该组中的所有其它标记，并且其中在组中具有共同聚集体的任何标签组中，每个标记具有与该组中所有其他质量标记部分的质量不同的质量标记部分，使得全部 组中的质量标记物通过质谱可以彼此区分，并且其中质量标记物部分包含氨基酸，质量标准化部分包含氨基酸。

公开(公告)号：US07163803B2

公开(公告)日：2007-01-16

申请号：US10479843

申请日：2002-06-07

申请人： Christian Hamon ,  Andrew Thompson ,  Thomas Neumann ,  Robert Johnstone ,  Abdul Karim Abed Mohammed

发明人： Christian Hamon ,  Andrew Thompson ,  Thomas Neumann ,  Robert Johnstone ,  Abdul Karim Abed Mohammed

IPC分类号： C12Q1/37

CPC分类号： G01N33/6848 ,  C07K1/12 ,  G01N33/6821

摘要： Provided is a method for characterizing a polypeptide, which method comprises the steps of: (a) optionally reducing cysteine disulphide bridges in the polypeptide to form free thiols, and capping the free thiols; (b) cleaving the polypeptide with a sequence specific cleavage reagent to form peptide fragments; (c) optionally deactivating the cleavage reagent; (d) capping one or more ε-amino groups that are present with a lysine reactive agent; (e) analyzing peptide fragments by mass spectrometry to form a mass fingerprint for the polypeptide; and (f) determining the identity of the polypeptide from the mass fingerprint.

摘要翻译： 提供了表征多肽的方法，该方法包括以下步骤：（a）任选地减少多肽中的半胱氨酸二硫键形成游离硫醇，并封端游离硫醇; （b）用序列特异性切割试剂切割多肽以形成肽片段; （c）任选地使切割试剂失活; （d）封端与赖氨酸反应剂一起存在的一个或多个ε-氨基; （e）通过质谱分析肽片段以形成多肽的质量指纹图谱; 和（f）从质量指纹图谱确定多肽的身份。

公开(公告)号：US20050042713A1

公开(公告)日：2005-02-24

申请号：US10479868

申请日：2002-06-07

申请人： Andrew Thompson ,  Christian Hamon ,  Thomas Neumann

发明人： Andrew Thompson ,  Christian Hamon ,  Thomas Neumann

IPC分类号： C07D495/04 ,  C07K1/113 ,  C07K1/12 ,  C12Q1/37 ,  G01N30/88 ,  G01N33/68 ,  C12P21/06 ,  C07K14/47

CPC分类号： G01N33/6848 ,  C07K1/12 ,  C07K1/128 ,  G01N33/6821

摘要： Provided is a method for characterising a polypeptide or a population of polypeptides, which method comprises the steps of: (a) optionally reducing disulphide linkages in the polypeptides, if they are present and capping free thiols in the polypeptides, if they are present; (b) contacting a sample comprising one or more polypeptides with a cleavage reagent which cleaves one or more polypeptides on the C-terminal side of a lysine residue to produce peptide fragments; (c) optionally deactivating the cleavage reagent; (d) contacting the sample with a lysine reactive agent to cap ε-amino groups; (e) removing those peptides having capped ε-amino groups; and (f) recovering the C-terminal peptides.

摘要翻译： 提供了表征多肽或多肽群体的方法，该方法包括以下步骤：（a）如果它们存在，任选地还原多肽中的二硫键，如果它们存在则任选地还原多肽中的无帽硫醇; （b）使包含一种或多种多肽的样品与裂解试剂接触，所述切割试剂在赖氨酸残基的C末端侧切割一个或多个多肽以产生肽片段; （c）任选地使切割试剂失活; （d）使样品与赖氨酸反应剂接触以将ε-氨基封端; （e）去除具有封端的ε-氨基的那些肽; 和（f）回收C末端肽。

公开(公告)号：US20050042676A1

公开(公告)日：2005-02-24

申请号：US10479855

申请日：2002-06-07

申请人： Christian Hamon ,  Andrew Thompson ,  Karsten Kuhn ,  Thomas Neumann ,  Richard Joubert ,  Robert Johnstone ,  Gunier Schmidt

发明人： Christian Hamon ,  Andrew Thompson ,  Karsten Kuhn ,  Thomas Neumann ,  Richard Joubert ,  Robert Johnstone ,  Gunier Schmidt

IPC分类号： C07D213/71 ,  C07D215/36 ,  C07D239/38 ,  C07D241/18 ,  C07D251/58 ,  C07K1/107 ,  C07K1/12 ,  C12Q1/02 ,  C12Q1/37 ,  G01N33/68 ,  G01N33/53

CPC分类号： G01N33/6848 ,  C07K1/12 ,  G01N33/6821

摘要： Provided is a method for characterising a polypeptide or a population of polypeptides, which method comprises the steps of: (a) contacting a sample comprising one or more polypeptides with a lysine reactive agent to cap ε-amino groups; (b) optionally reacting the sample of polypeptides with an amine reactive reagent to block α-amino groups; (c) digesting the sample of polypeptides with a cleavage reagent to produce peptide fragments; (d) optionally deactivating the cleavage reagent; (e) removing those peptides having uncapped or unblocked amino groups; and (f) recovering the N-terminal peptides.

摘要翻译： 提供了表征多肽或多肽群体的方法，该方法包括以下步骤：（a）将包含一种或多种多肽的样品与赖氨酸反应剂接触以将ε-氨基封端; （b）任选地使多肽样品与胺反应试剂反应以阻断α-氨基; （c）用裂解试剂消化多肽样品以产生肽片段; （d）任选地使切割试剂失活; （e）除去具有未封端或未封闭的氨基的那些肽; 和（f）回收N-末端肽。

公开(公告)号：US07732378B2

公开(公告)日：2010-06-08

申请号：US10489341

申请日：2002-09-16

申请人： Andrew Hugin Thompson ,  Christian Hamon ,  Jurgen Schafer ,  Karsten Kuhn ,  Joseph Schwarz ,  Thomas Neumann

发明人： Andrew Hugin Thompson ,  Christian Hamon ,  Jurgen Schafer ,  Karsten Kuhn ,  Joseph Schwarz ,  Thomas Neumann

IPC分类号： C40B40/00

CPC分类号： G01N33/6848 ,  G01N33/68 ,  G01N33/6851 ,  G01N2458/15 ,  H01J49/04

摘要： Provided is a set of two or more mass labels, each label in the set comprising a mass marker moiety attached via a cleavable linker having at least one amide bond to a mass normalization moiety, wherein the aggregate mass of each label in the set may be the same or different and the mass of the mass marker moiety of each label in the set may be the same or different, and wherein in any group of labels within the set having a mass marker moiety of a common mass each label has an aggregate mass different from all other labels in that group, and wherein in any group of labels within the set having a common aggregate mass each label has a mass marker moiety having a mass different from that of all other mass marker moieties in that group, such that all of the mass labels in the set are distinguishable from each other by mass spectrometry, and wherein the mass marker moiety comprises an amino acid and the mass normalization moiety comprises an amino acid.

摘要翻译： 提供了一组两个或更多个质量标签，该组中的每个标签包含通过具有至少一个酰胺键与质量标准化部分连接的质量标记部分，其中该组中每个标签的总质量可以是 相同或不同，组中每个标记物的质量标记物部分的质量可以相同或不同，并且其中在具有共同质量的质量标记物部分的组中的任何标签组中，每个标签具有总体质量 不同于该组中的所有其它标记，并且其中在组中具有共同聚集体的任何标签组中，每个标记具有与该组中所有其他质量标记部分的质量不同的质量标记部分，使得全部 组中的质量标记物通过质谱法彼此区分，并且其中质量标记物部分包含氨基酸，质量标准化部分包含氨基酸。

公开(公告)号：US07700306B2

公开(公告)日：2010-04-20

申请号：US10510246

申请日：2003-04-04

申请人： Andrew H. Thompson ,  Christian Hamon ,  Karsten Kuhn ,  Markus Meyer ,  Schafer Juergen ,  Thomas Neumann

发明人： Andrew H. Thompson ,  Christian Hamon ,  Karsten Kuhn ,  Markus Meyer ,  Schafer Juergen ,  Thomas Neumann

IPC分类号： G01N33/00

CPC分类号： G01N33/6848 ,  C07K1/13 ,  G01N33/6851

摘要： Provided is a method for characterizing an analyte by matrix assisted laser desorption ionization (MALDI) mass spectrometry, which method comprises: (a) labelling the analyte with a light-absorbing label that absorbs light at a pre-determined frequency, to form a labelled analyte; (b) embedding the labelled analyte in a matrix formed from at least one compound that absorbs light, to form an embedded labelled analyte; (c) desorbing the embedded labelled analyte by exposing it to light having the pre-determined frequency, to form a desorbed analyte; and (d) detecting the desorbed analyte by mass spectrometry to characterize the analyte.

摘要翻译： 本发明提供了一种通过基质辅助激光解吸电离（MALDI）质谱法分析分析物的方法，该方法包括：（a）用预吸收光量的光吸收标记标记分析物，以形成标记的 分析物; （b）将标记的分析物包埋在由吸收光的至少一种化合物形成的基质中，以形成嵌入的标记分析物; （c）通过将嵌入的标记分析物暴露于具有预定频率的光来解吸，形成解吸附的分析物; 和（d）通过质谱检测解吸附的分析物来表征分析物。

公开(公告)号：US08445280B2

公开(公告)日：2013-05-21

申请号：US12679429

申请日：2008-09-24

申请人： Thomas Neumann ,  Anna Tourovskaia ,  Mark E. Fauver ,  Julia Oi Yan Yu

发明人： Thomas Neumann ,  Anna Tourovskaia ,  Mark E. Fauver ,  Julia Oi Yan Yu

IPC分类号： C12N5/07

CPC分类号： A61L27/3808 ,  A61L27/3886 ,  C12M21/08 ,  C12M25/14 ,  C12M29/10 ,  C12N5/0068 ,  C12N5/0691 ,  C12N2533/50

摘要： A method for creating networks of perfusable microvessels in vitro. Cells including cell types capable of sprouting are seeded 1300 into a channel in a matrix at to activate competency 1304 of the cells for sprouting as microvessels based on the seeding density. The matrix channel is perfused with medium to allow parent vessels to form and for viability 1324. The parent vessels and matrix are incubated and perfused to provide for sprouting of microvessels from parent vessels into the surrounding matrix 1328. The sprouting parent vessels are grown until network forms 1332.

摘要翻译： 一种在体外创建可灌注微血管网络的方法。 将包括能够发芽的细胞类型的细胞接种在基质中的通道中，以基于接种密度激活细胞的能力1304作为微血管发芽。 基质通道用培养基灌注以允许母体血管形成和存活力1324.将母体血管和基质温育并灌注以提供将微血管从亲本血管发芽到周围基质1328中。将发芽的母血管生长直至网络 表格1332。

公开(公告)号：US20120105600A1

公开(公告)日：2012-05-03

申请号：US12999515

申请日：2009-06-08

申请人： Michael G. Meyer ,  J. Richard Rahn ,  Anna V. Tourovskaia ,  Julia Oi Yan Yu ,  Christy A. Lancaster ,  Thomas Neumann ,  Mark E. Fauver

发明人： Michael G. Meyer ,  J. Richard Rahn ,  Anna V. Tourovskaia ,  Julia Oi Yan Yu ,  Christy A. Lancaster ,  Thomas Neumann ,  Mark E. Fauver

IPC分类号： H04N13/02

CPC分类号： G06T11/006 ,  G01N15/1434 ,  G01N15/1475 ,  G01N21/49 ,  G01N21/6458 ,  G01N2015/1445

摘要： A method for 3D imaging of a biologic object (1) in an optical tomography system where a subcellular structure of a biological object (1) is labeled by introducing at least one nanoparticle-biomarker. The labeled biological object (1) is moved relatively to a microscope objective (62) to present varying angles of view and the labeled biological object (1) is illuminated with radiation having wavelengths between 150 nm and 900 nm. Radiation transmitted through the labeled biological object (1) and the microscope objective (62) within at least one wavelength bands is sensed with a color camera, or with a set of at least four monochrome cameras. A plurality of cross-sectional images of the biological object (1) from the sensed radiation is formed and reconstructed to make a 3D image of the labeled biological object (1).

摘要翻译： 一种用于在其中通过引入至少一种纳米颗粒 - 生物标志物标记生物体（1）的亚细胞结构的光学层析成像系统中的生物物体（1）的3D成像的方法。 标记的生物体（1）相对于显微镜物镜（62）移动以呈现不同的视角，并且用波长在150nm和900nm之间的辐射照射标记的生物物体（1）。 用彩色照相机或一组至少四个单色照相机检测在至少一个波长带内通过标记的生物物体（1）和显微镜物镜（62）发射的辐射。 形成并重构来自感测辐射的生物体（1）的多个横截面图像，以便制成标记的生物体（1）的3D图像。

公开(公告)号：US08003388B2

公开(公告)日：2011-08-23

申请号：US11860471

申请日：2007-09-24

申请人： Thomas Neumann

发明人： Thomas Neumann

IPC分类号： C12N5/00

CPC分类号： A61L27/3808 ,  C12M21/08 ,  C12M23/06 ,  C12M23/20 ,  C12M25/14 ,  C12M29/10 ,  C12N5/0068 ,  C12N5/0691 ,  C12N2533/50

摘要： A method for creating networks of perfusable microvessels in vitro. A mandrel is drawn through a matrix to form a channel through the matrix. Cells are injected into the channel. The matrix is incubated to allow the cells to attach inside the channel. The channel is perfused to remove unattached cells to create a parent vessel, where the parent vessel includes a perfusable hollow channel lined with cells in the matrix. The parent vessel is induced to create sprouts into the surrounding matrix gel so as to form a microvessel network. The microvessel network is subjected to luminal perfusion through the parent vessel.

摘要翻译： 一种在体外创建可灌注微血管网络的方法。 心轴通过矩阵绘制以形成通过矩阵的通道。 细胞注入通道。 将基质温育以使细胞附着在通道内。 灌注通道以除去未附着的细胞以产生亲本血管，其中母体血管包括排列在基质中的细胞的可灌注中空通道。 诱导母体容器以产生芽至周围的基质凝胶中，从而形成微血管网络。 微血管网络通过母体血管进行腔灌注。