公开(公告)号：US06947846B2

公开(公告)日：2005-09-20

申请号：US10289141

申请日：2002-11-05

申请人： Stephen R. Quake ,  R. Michael van Dam ,  James P. Brody ,  Rebecca Shafee

发明人： Stephen R. Quake ,  R. Michael van Dam ,  James P. Brody ,  Rebecca Shafee

IPC分类号： G06F17/15 ,  G06F19/20 ,  G06F19/24 ,  G06F17/00

CPC分类号： G06F19/20 ,  G06F17/15 ,  G06F19/24

摘要： Techniques for processing gene expression data and predicting gene relationships are provided. More specifically, a method for processing gene expression ratios may include discretizing a first expression ratio for a first gene and a second expression ratio for a second gene for each of a plurality of experiments into one of three indications, calculating the probability that the combination of the discretized expression ratios for each of the plurality of experiments arises by random chance, and determining whether the first gene and the second gene are related.

摘要翻译： 提供了处理基因表达数据和预测基因关系的技术。 更具体地，用于处理基因表达比率的方法可以包括将用于第一基因的第一表达比率和第二基因的第二表达比率分离为三个指示之一，以计算出三个指示中的一个的概率， 多个实验中的每一个的离散化表达比均由随机机会产生，并且确定第一基因和第二基因是否相关。

公开(公告)号：US06958865B1

公开(公告)日：2005-10-25

申请号：US10603502

申请日：2003-06-24

申请人： Stephen R. Quake ,  James P. Brody

发明人： Stephen R. Quake ,  James P. Brody

IPC分类号： G02B6/32 ,  G02B6/42 ,  G02B21/00 ,  G02B3/00

CPC分类号： G02B6/32 ,  G02B6/4204 ,  G02B6/4206 ,  G02B21/0072

摘要： A microscopic lens, of size approximately 1 micron is used for its optical characteristics.

公开(公告)号：US07248413B2

公开(公告)日：2007-07-24

申请号：US11095332

申请日：2005-03-30

申请人： Stephen R. Quake ,  James P. Brody

发明人： Stephen R. Quake ,  James P. Brody

IPC分类号： G02B11/00 ,  G02B3/00 ,  G02B27/02 ,  H01J3/14

CPC分类号： G02B6/32 ,  G02B6/4204 ,  G02B6/4206 ,  G02B21/0072

摘要： A microscopic lens, of size approximately 1 micron is used for its optical characteristics.

摘要翻译： 尺寸约为1微米的微观透镜用于其光学特性。

公开(公告)号：US06614598B1

公开(公告)日：2003-09-02

申请号：US09441152

申请日：1999-11-12

申请人： Stephen R. Quake ,  James P. Brody

发明人： Stephen R. Quake ,  James P. Brody

IPC分类号： G02B300

CPC分类号： G02B6/4204 ,  G02B6/32 ,  G02B6/4206 ,  G02B21/0072

摘要： A microscopic lens, of size approximate 1 micron is used for its optical characteristics.

摘要翻译： 尺寸约为1微米的微观透镜用于其光学特性。

公开(公告)号：US06387290B1

公开(公告)日：2002-05-14

申请号：US09346717

申请日：1999-07-02

申请人： James P. Brody ,  Thor D. Osborn

发明人： James P. Brody ,  Thor D. Osborn

IPC分类号： C03C1500

CPC分类号： G01N33/491 ,  B01D39/1692 ,  B01D61/18 ,  B01D67/0058 ,  B01D67/0062 ,  B01D71/02 ,  B01D2323/00 ,  B01D2323/08 ,  B01D2323/12 ,  B01L3/502753 ,  B01L2200/12 ,  B01L2300/0681 ,  B01L2300/0816 ,  B01L2300/0864 ,  B01L2400/0406 ,  B01L2400/0487 ,  Y10S977/904 ,  Y10T436/25375

摘要： A microfilter utilizing the principles of tangential flow to prevent clogging, and sloped channel sides to overcome surface tension effects is provided which has feed inlet and exit connected by a feed flow channel; a barrier channel parallel to the feed flow channel, and a filtrate collection channel parallel to the barrier channel so that liquid can flow from the feed flow channel through the barrier channel which is too small to accommodate the particles, into the filtrate collection channel, and from then through a filtrate flow channel to a filtrate exit. Several picoliters of cell-free plasma are recovered from one drop of blood for analysis.

摘要翻译： 提供了利用切向流动原理以防止堵塞的微过滤器和用于克服表面张力效应的倾斜通道侧，其具有通过进料流动通道连接的进料入口和出口; 平行于进料流通道的阻挡通道和平行于阻挡通道的滤液收集通道，使得液体可以从进料流动通道通过阻挡通道，其过小而不能容纳颗粒进入滤液收集通道，以及 从此通过滤液流通道到滤液出口。 从一滴血液中回收几个无细胞血浆的皮升卵，用于分析。

公开(公告)号：US5972710A

公开(公告)日：1999-10-26

申请号：US829679

申请日：1997-03-31

申请人： Bernhard H. Weigl ,  Paul Yager ,  James P. Brody ,  Mark R. Holl ,  Margaret Kenny ,  David Schutte ,  Gregory Hixson ,  M. Diane Zebert ,  Andrew Kamholz ,  Caicai Wu ,  Eric Altendorf

发明人： Bernhard H. Weigl ,  Paul Yager ,  James P. Brody ,  Mark R. Holl ,  Margaret Kenny ,  David Schutte ,  Gregory Hixson ,  M. Diane Zebert ,  Andrew Kamholz ,  Caicai Wu ,  Eric Altendorf

IPC分类号： G01N37/00 ,  B01F5/04 ,  B01F13/00 ,  B01J19/00 ,  B01L3/00 ,  G01N15/06 ,  G01N15/14 ,  G01N30/00 ,  G01N30/38 ,  G01N30/60 ,  G01N30/74 ,  G01N31/20 ,  G01N35/08 ,  G01N21/64

CPC分类号： B01F5/0403 ,  B01F13/0059 ,  B01F13/0093 ,  B01J19/0093 ,  B01L3/502776 ,  G01N30/0005 ,  B01J2219/00828 ,  B01J2219/00831 ,  B01J2219/00952 ,  B01L2200/0636 ,  B01L2300/0654 ,  B01L2300/0816 ,  B01L2300/0861 ,  B01L2300/0867 ,  B01L2300/087 ,  B01L2400/0487 ,  G01N15/14 ,  G01N30/38 ,  G01N30/6095 ,  G01N30/74 ,  G01N35/085 ,  Y10S366/01 ,  Y10T436/25375 ,  Y10T436/2575

摘要： A channel-cell system is provided for detecting the presence and/or measuring the presence of analyte particles in a sample stream comprising: a) a laminar flow channel; b) two inlets in fluid connection with the laminar flow channel for respectively conducting into the laminar flow channel (1) an indicator stream which may comprise an indicator substance which indicates the presence of the analyte particles by a detectable change in property when contacted with the analyte particles, and (2) the sample stream; c) wherein the laminar flow channel has a depth sufficiently small to allow laminar flow of the streams and a length sufficient to allow particles of the analyte to diffuse into the indicator stream to the substantial exclusion of the larger particles in the sample stream to form a detection area; and d) an outlet for conducting the streams out of the laminar flow channel to form a single mixed stream.

摘要翻译： 提供了一种通道细胞系统，用于检测样品流中存在和/或测量分析物颗粒的存在，其包括：a）层流通道; b）与层流通道流体连接的两个入口，用于分别导入层流通道（1）中，指示物流可包含指示物质，其指示物质与当与 分析物颗粒，和（2）样品流; c）其中层流通道具有足够小的深度以允许流的层流，并且足够的长度允许分析物的颗粒扩散到指示物流中，从而基本排除样品流中的较大颗粒，形成 检测区; 和d）用于将物流从层流通道导出以形成单一混合流的出口。

公开(公告)号：US5932100A

公开(公告)日：1999-08-03

申请号：US663916

申请日：1996-06-14

申请人： Paul Yager ,  James P. Brody ,  Mark R. Holl ,  Fred K. Forster ,  Paul C. Galambos

发明人： Paul Yager ,  James P. Brody ,  Mark R. Holl ,  Fred K. Forster ,  Paul C. Galambos

IPC分类号： B01D11/00 ,  B01D11/02 ,  B01D11/04 ,  B01D43/00 ,  B01F13/00 ,  B01J19/00 ,  G01N1/02 ,  G01N1/10 ,  G01N1/40 ,  G01N15/06 ,  G01N30/00 ,  G01N35/00 ,  G01N37/00

CPC分类号： B01D11/0492 ,  B01D11/0496 ,  B01F13/0059 ,  B01F13/0093 ,  B01J19/0093 ,  G01N15/06 ,  G01N30/0005 ,  B01F2005/0031 ,  B01J2219/00783 ,  B01J2219/00828 ,  B01J2219/00889 ,  B01J2219/00905 ,  B01J2219/00952 ,  B01J2219/0097 ,  B01J2219/00995 ,  G01N2001/4072 ,  G01N2035/00237 ,  Y10S366/01 ,  Y10T436/255

摘要： This invention provides a microfabricated extraction system and methods for extracting desired particles from a sample stream containing desired and undesired particles. The sample stream is placed in laminar flow contact with an extraction stream under conditions in which inertial effects are negligible. The contact between the two streams is maintained for a sufficient period of time to allow differential transport of the desired particles from the sample stream into the extraction stream. In a preferred embodiment the differential transport mechanism is diffusion. The extraction system of this invention coupled to a microfabricated diffusion-based mixing device and/or sensing device allows picoliter quantities of fluid to be processed or analyzed on devices no larger than silicon wafers.

摘要翻译： 本发明提供了一种微加工提取系统和从含有所需和不需要的颗粒的样品流中提取所需颗粒的方法。 在惯性效应可忽略的条件下，将样品流与提取流层流接触。 保持两个物流之间的接触足够的时间，以便将期望的颗粒从样品流中差分输送到萃取物流中。 在优选实施例中，差分传送机构是扩散。 本发明的提取系统耦合到基于微制造的基于扩散的混合装置和/或感测装置允许在不大于硅晶片的装置上处理或分析皮升数量的流体。

公开(公告)号：US5922210A

公开(公告)日：1999-07-13

申请号：US665218

申请日：1996-06-14

申请人： James P. Brody ,  Thor D. Osborn

发明人： James P. Brody ,  Thor D. Osborn

IPC分类号： B01D39/16 ,  B01D61/18 ,  B01D67/00 ,  B01D71/02 ,  B01L3/00 ,  G01N33/49 ,  B01D35/00 ,  B01D37/00 ,  G01N33/48

CPC分类号： G01N33/491 ,  B01D39/1692 ,  B01D61/18 ,  B01D67/0058 ,  B01D67/0062 ,  B01D71/02 ,  B01L3/502753 ,  B01D2323/00 ,  B01D2323/08 ,  B01D2323/12 ,  B01L2200/12 ,  B01L2300/0681 ,  B01L2300/0816 ,  B01L2300/0864 ,  B01L2400/0406 ,  B01L2400/0487 ,  Y10S977/904 ,  Y10T436/25375

摘要： A microfilter utilizing the principles of tangential flow to prevent clogging, and sloped channel sides to overcome surface tension effects is provided which has feed inlet and exit connected by a feed flow channel, a barrier channel parallel to the feed flow channel, and a filtrate collection channel parallel to the barrier channel so that liquid can flow from the feed flow channel through the barrier channel which is too small to accommodate the particles, into the filtrate collection channel, and from then through a filtrate flow channel to a filtrate exit. Several picoliters of cell-free plasma are recovered from one drop of blood for analysis.

摘要翻译： 提供了利用切向流动原理以防止堵塞的微过滤器和用于克服表面张力效应的倾斜通道侧，其具有通过进料流动通道连接的进料入口和出口，平行于进料流动通道的阻挡通道和滤液收集 通道平行于阻挡通道，使得液体可以从进料流动通道穿过阻挡通道，其过小而不能容纳颗粒，进入滤液收集通道，然后从滤液流动通道流到滤液出口。 从一滴血液中回收几个无细胞血浆的皮升卵，用于分析。

公开(公告)号：US06695147B1

公开(公告)日：2004-02-24

申请号：US09416072

申请日：1999-10-12

申请人： Paul Yager ,  James P. Brody

发明人： Paul Yager ,  James P. Brody

IPC分类号： B03B500

CPC分类号： G01N30/0005 ,  A61M1/3679 ,  B01J19/0093 ,  B01J2219/00828 ,  B01J2219/00952 ,  B01J2219/00995 ,  B03B5/00 ,  G01N30/02 ,  G01N30/6095 ,  G01N2030/582 ,  Y10S366/01 ,  B01D15/3804

摘要： This invention provides an extraction device and a method for extracting desired particles from a sample stream containing the desired particles. The device has a sample stream inlet, an extraction stream inlet, and an extraction channel in fluid communication with the sample stream inlet and the extraction stream inlet. The extraction channel is for receiving a sample stream from the sample stream inlet in adjacent laminar flow with an extraction stream from the extraction stream inlet. A sequestering material within the extraction channel captures desired particles in the extraction stream. A by-product stream outlet in fluid communication with the extraction channel receives a by-product stream comprising at least a portion of the sample stream form which desired particles have been extracted. A product outlet in fluid communication with the extraction channel receives a product which has the sequestering material and at least a portion of the desired particles.

摘要翻译： 本发明提供一种提取装置和从含有所需颗粒的样品流中提取所需颗粒的方法。 该装置具有样品流入口，萃取流入口和与样品流入口和萃取流入口流体连通的萃取通道。 提取通道用于从相邻层流中的样品流入口接收来自萃取流入口的萃取物流的样品流。 提取通道内的螯合材料捕获萃取流中所需的颗粒。 与提取通道流体连通的副产物流出口接收包含至少一部分样品流形式的副产物流，所述样品流形式已经被提取出所需的颗粒。 与提取通道流体连通的产品出口接收具有隔离材料和至少一部分所需颗粒的产品。

公开(公告)号：US06454945B1

公开(公告)日：2002-09-24

申请号：US09703764

申请日：2000-11-01

申请人： Bernhard H. Weigl ,  Paul Yager ,  James P. Brody ,  Mark R. Holl ,  Fred K. Forster ,  Eric Altendorf ,  Paul C. Galambos ,  Margaret Kenny ,  David Schutte ,  Gregory Hixson ,  Diane Zebert ,  Andrew Kamholz ,  Caicai Wu

发明人： Bernhard H. Weigl ,  Paul Yager ,  James P. Brody ,  Mark R. Holl ,  Fred K. Forster ,  Eric Altendorf ,  Paul C. Galambos ,  Margaret Kenny ,  David Schutte ,  Gregory Hixson ,  Diane Zebert ,  Andrew Kamholz ,  Caicai Wu

IPC分类号： B02D1100

CPC分类号： B01D11/0492 ,  A61M1/14 ,  B01D11/0496 ,  B01L3/5027 ,  B01L3/502761 ,  B01L3/502776 ,  B01L2200/0636 ,  B01L2300/0816 ,  B01L2300/0867 ,  B01L2400/0406 ,  B01L2400/0487 ,  G01N15/1484 ,  Y10T436/25375

摘要： This invention provides microfabricated systems for extraction of desired particles from a sample stream containing desired and undesired particles. The sample stream is placed in laminar flow contact with an extraction stream under conditions in which inertial effects are negligible. The contact between the two streams is maintained for a sufficient period of time to allow differential transport of the desired particles from the sample stream into the extraction stream. In a preferred embodiment the differential transport mechanism is diffusion. The extraction system of this invention coupled to a microfabricated diffusion-based mixing device and/or sensing means allows picoliter quantities of fluid to be processed or analyzed on devices no larger than silicon wafers. Such diffusion-based mixing or sensing devices are preferably channel cell systems for detecting the presence and/or measuring the quantity of analyte particles in a sample stream.

摘要翻译： 本发明提供了用于从含有所需和不需要的颗粒的样品流中提取所需颗粒的微制造系统。 在惯性效应可忽略的条件下，将样品流与提取流层流接触。 保持两个物流之间的接触足够的时间，以便将期望的颗粒从样品流中差分输送到萃取物流中。 在优选实施例中，差分传送机构是扩散。 本发明的提取系统耦合到基于微制造的基于扩散的混合装置和/或感测装置允许在不大于硅晶片的装置上处理或分析皮升数量的流体。 这种基于扩散的混合或感测装置优选是用于检测样品流中分析物颗粒的存在和/或测量量的通道电池系统。