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    Multiplex amplification and detection
    31.
    发明授权
    Multiplex amplification and detection 有权
    多重放大和检测

    公开(公告)号：US09234232B2

    公开(公告)日：2016-01-12

    申请号：US13056422

    申请日：2009-07-30

    申请人： Guoliang Fu

    发明人： Guoliang Fu

    IPC分类号： C12Q1/68

    CPC分类号： C12Q1/686 ,  C12Q1/6818 ,  C12Q1/6823 ,  C12Q1/6851 ,  C12Q1/6853 ,  C12Q2565/101 ,  C12Q2561/113 ,  C12Q2537/143 ,  C12Q2537/1373 ,  C12Q2527/107 ,  C12Q2525/161

    摘要： The invention relates to the field of multiplex amplification. In particular, the invention relates to methods for assaying a sample for one or more nucleic acid targets in a single reaction based on the distinct melting temperatures or melting profiles of primers and/or probes. The invention also provides probes and kits for use in such methods.

    摘要翻译： 本发明涉及多重放大的领域。 特别地，本发明涉及基于引物和/或探针的不同熔解温度或熔融曲线在单一反应中测定一种或多种核酸靶标的样品的方法。 本发明还提供了用于这些方法的探针和试剂盒。

    Real time microarrays
    34.
    发明授权
    Real time microarrays 有权
    实时微阵列

    公开(公告)号：US09133504B2

    公开(公告)日：2015-09-15

    申请号：US11758621

    申请日：2007-06-05

    申请人： Arjang Hassibi ,  Babak Hassibi ,  Haris Vikalo ,  Jose Luis Riechmann

    发明人： Arjang Hassibi ,  Babak Hassibi ,  Haris Vikalo ,  Jose Luis Riechmann

    IPC分类号： C12Q1/68

    CPC分类号： C12Q1/6837 ,  C12Q1/6818 ,  C12Q2565/501 ,  C12Q2565/101 ,  C12Q2561/113

    摘要： This invention provides methods and systems for measuring the binding of analytes in solution to probes bound to surfaces in real-time. The method involves contacting a fluid volume having a plurality of different analytes with a solid substrate having a plurality of different probes. The probes are capable of specifically binding to the analytes. The method also involves measuring signals at multiple time points while the fluid volume is in contact with the substrate. The signals measured at multiple time points can be correlated with the amount of binding of the analytes with the probes. The method eliminates the need to wash the probes before measuring the binding characteristics.

    摘要翻译： 本发明提供了用于测量溶液中分析物与实际上与表面结合的探针的结合的方法和系统。 该方法包括将具有多个不同分析物的流体体积与具有多个不同探针的固体基质接触。 探针能够特异性地结合分析物。 该方法还涉及在流体体积与基底接触时在多个时间点测量信号。 在多个时间点测量的信号可以与分析物与探针的结合量相关。 该方法消除了在测量结合特性之前洗涤探针的需要。

    OPTICAL PROCESSING
    35.
    发明申请
    OPTICAL PROCESSING 有权
    光学处理

    公开(公告)号：US20150248524A1

    公开(公告)日：2015-09-03

    申请号：US14431914

    申请日：2013-08-07

    申请人： EPISTEM LIMITED

    发明人： Benjamin David Cobb ,  David Andrew Barr

    IPC分类号： G06F19/22 ,  G06F19/24 ,  G01N21/64 ,  B01L7/00

    CPC分类号： G06F19/22 ,  B01L7/52 ,  C12Q1/686 ,  G01N21/64 ,  G01N21/6428 ,  G01N21/6486 ,  G06F19/24 ,  C12Q2527/107 ,  C12Q2537/165 ,  C12Q2561/113

    摘要： We describe a quantitative PCR (qPCR) instrument for combined qPCR and melt curve (dissociation and/or association curve) analysis. The instrument has at least one optical channel; a fluorescence excitation source; a fluorescence detector; an electronic analogue signal amplifier having an input coupled to an output of the fluorescence detector; and an analogue-to-digital converter (ADC) having analogue input coupled to an output of the analogue signal amplifier. The instrument further comprises a quantified automatic gain control (AGC) loop coupled between the signal output of the fluorescence detector and the analogue input of the ADC. The AGC loop is configured to apply a determined, numerical gain value to a fluorescence signal for the analogue input of the ADC. The instrument also includes a system to scale a digital output of the ADC responsive to the numerical gain value and to provide a digital fluorescence level signal from the scaled digital output.

    摘要翻译： 我们描述了用于组合qPCR和熔解曲线（解离和/或结合曲线）分析的定量PCR（qPCR）仪器。 仪器至少有一个光通道; 荧光激发源; 荧光检测器 具有耦合到所述荧光检测器的输出的输入的电子模拟信号放大器; 以及具有耦合到模拟信号放大器的输出的模拟输入的模拟 - 数字转换器（ADC）。 该仪器还包括耦合在荧光检测器的信号输出和ADC的模拟输入端之间的量化的自动增益控制（AGC）回路。 AGC环路被配置为将用于ADC的模拟输入的确定的数字增益值应用于荧光信号。 该仪器还包括一个系统，可以根据数字增益值来缩放ADC的数字输出，并提供数字荧光电平信号。

    Device and method for digital multiplex PCR assays
    36.
    发明授权
    Device and method for digital multiplex PCR assays 有权
    数字多重PCR测定的装置和方法

    公开(公告)号：US09114398B2

    公开(公告)日：2015-08-25

    申请号：US11947227

    申请日：2007-11-29

    申请人： Ivor T. Knight ,  Hiroshi Inoue

    发明人： Ivor T. Knight ,  Hiroshi Inoue

    IPC分类号： C12Q1/68 ,  C12P19/34 ,  B01L7/00 ,  B01L3/00 ,  G01N21/64 ,  G06F19/22 ,  G01N21/03 ,  G01N21/05

    CPC分类号： B01L7/52 ,  B01L3/5027 ,  B01L2200/147 ,  B01L2300/0864 ,  C12Q1/686 ,  G01N21/0332 ,  G01N21/05 ,  G01N21/6452 ,  G01N21/6456 ,  G01N2021/0346 ,  G06F19/22 ,  C12Q2565/629 ,  C12Q2561/113

    摘要： A method and device for digital multiplex PCR assays employ a microfluidic chip for performing real-time, continuous flow PCR within microchannels of the chip. A stream of sample material is introduced into each microchannel and alternating boluses of assay-specific reagents and buffer are introduced into the stream to form sequentially configured test boluses. A PCR procedure is performed on the test boluses followed by a thermal melt procedure. During the thermal melt procedure, fluorescent output is detected and fluorescence vs temperature data is collected and compared to expected normal correlations. The results, positive or negative, are converted to digital format, with positive results designated as “1” and negative results designated as “0”, or vice versa.

    摘要翻译： 用于数字多重PCR测定的方法和装置使用微流体芯片来在芯片的微通道内进行实时连续流动PCR。 将样品材料流引入每个微通道中，并将测定特异性试剂和缓冲液的交替喷射引入流中以形成顺序配置的测试推注。 在测试团块上进行PCR程序，然后进行热熔融程序。 在热熔化过程中，检测荧光输出，并收集荧光对温度数据并与预期的正常相关性进行比较。 结果，正或负转换为数字格式，阳性结果指定为“1”，负结果指定为“0”，反之亦然。

    Quantification of human mitochondrial DNA using synthesized DNA standards
    38.
    发明授权
    Quantification of human mitochondrial DNA using synthesized DNA standards 有权
    使用合成DNA标准对人线粒体DNA进行定量

    公开(公告)号：US09080205B2

    公开(公告)日：2015-07-14

    申请号：US13436277

    申请日：2012-03-30

    申请人： Mark F. Kavlick ,  Bruce Budowle

    发明人： Mark F. Kavlick ,  Bruce Budowle

    IPC分类号： C12Q1/68

    CPC分类号： C12Q1/6883 ,  C12Q1/6851 ,  C12Q2545/101 ,  C12Q2600/158 ,  C12Q2531/113 ,  C12Q2561/113

    摘要： A real-time quantitative PCR assay that utilizes a duplex, synthetic DNA standard to ensure optimal quality assurance and quality control. One embodiment of the invention facilitates amplification of mtDNA by focusing on a 105-base pair target sequence that is minimally homologous to non-human mtDNA. The present invention can also be used to identify the presence of PCR inhibitors and thus indicate the need for sample repurification.

    摘要翻译： 实时定量PCR检测，利用双工合成DNA标准，确保最佳质量保证和质量控制。 本发明的一个实施方案通过集中于与非人mtDNA最小同源的105个碱基对靶序列来促进mtDNA的扩增。 本发明还可以用于鉴定PCR抑制剂的存在，因此表明需要样品再纯化。

    FRET-BASED ANALYTES DETECTION AND RELATED METHODS AND SYSTEMS
    40.
    发明申请
    FRET-BASED ANALYTES DETECTION AND RELATED METHODS AND SYSTEMS 审中-公开
    基于FRET的分析检测及相关方法和系统

    公开(公告)号：US20150167092A1

    公开(公告)日：2015-06-18

    申请号：US14633094

    申请日：2015-02-26

    申请人： CALIFORNIA INSTITUTE OF TECHNOLOGY

    发明人： Emil P. KARTALOV ,  Aditya RAJAGOPAL ,  Axel SCHERER ,  Mark D. GOLDBERG

    IPC分类号： C12Q1/68

    CPC分类号： C12Q1/6883 ,  C12Q1/68 ,  C12Q1/6851 ,  C12Q1/701 ,  C12Q1/703 ,  C12Q2600/156 ,  Y10T436/143333 ,  C12Q2561/113 ,  C12Q2565/101 ,  C12Q2527/101 ,  C12Q2565/1015 ,  C12Q2565/133

    摘要： FRET-based analytes detection and related methods and systems are described where a pair of FRET labeled primers and/or oligonucleotides are used that are specific for target sequences located at a distance up to four time the Förster distance of the FRET chromophores presented on the FRET labeled primers and/or oligonucleotides one with respect to the other in one or more polynucleotide analyte; in particular the pair of FRET labeled primers and/or oligonucleotides is combined with a sample and subjected to one or more polynucleotide amplification reactions before measuring FRET signals from at least one FRET chromophore.

    摘要翻译： 描述了基于FRET的分析物检测和相关方法和系统，其中使用一对FRET标记的引物和/或寡核苷酸，其特异于靶向序列，其位于与FRET上呈现的FRET发色团的Förster距离的四倍 在一个或多个多核苷酸分析物中相对于另一个标记的引物和/或寡核苷酸; 特别地，一对FRET标记的引物和/或寡核苷酸与样品组合，并在测量来自至少一种FRET生色团的FRET信号之前进行一个或多个多核苷酸扩增反应。