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    Ribonucleic acid identification apparatus, ribonucleic acid identification method, program and ribonucleic acid identification system
    12.
    发明授权
    Ribonucleic acid identification apparatus, ribonucleic acid identification method, program and ribonucleic acid identification system 有权
    核糖核酸鉴定仪，核糖核酸鉴定方法，程序和核糖核酸鉴定系统

    公开(公告)号：US08880353B2

    公开(公告)日：2014-11-04

    申请号：US12988037

    申请日：2009-04-17

    申请人： Hiroshi Nakayama ,  Misaki Akiyama ,  Toshiaki Isobe ,  Masato Taoka ,  Yoshio Yamauchi ,  Nobuhiro Takahashi ,  Hideaki Ishikawa

    发明人： Hiroshi Nakayama ,  Misaki Akiyama ,  Toshiaki Isobe ,  Masato Taoka ,  Yoshio Yamauchi ,  Nobuhiro Takahashi ,  Hideaki Ishikawa

    IPC分类号： G01N33/48 ,  C12Q1/68 ,  H01J49/00

    CPC分类号： C12Q1/6872 ,  H01J49/00 ,  C12Q2521/307

    摘要： Disclosed are an apparatus for the identification of a ribonucleic acid, whereby not only the molecular weights of digestion products, from which nothing but the nucleic acid residue composition can be understood, but also nucleic acid residue sequence data is obtained from a product ion mass set and thus the identification reliability for the individual digestion products can be remarkably improved; a method for the identification of a ribonucleic acid; and a program and system for the identification of a ribonucleic acid. The method as described above comprises: searching for nucleic acid sequence database by using a fragment mass set indicating the molecular weights and inner structural data of individual oligonucleotides that are obtained by tandem mass spectrometry on digested oligonucleotides formed by chemically or enzymatically cleaving a ribonucleic acid; scoring candidate sequences; among candidate sequences showing the highest scores, referring those showing scores exceeding the threshold as identified sequences; and using these identified sequences in mapping on nucleic acid sequence database including genomic sequences.

    摘要翻译： 公开了用于鉴定核糖核酸的装置，其不仅可以理解除了核酸残基组成之外的消化产物的分子量，还可以从核酸残基序列数据获得产物离子质量组 从而可以显着提高个体消化产品的鉴定可靠性; 用于鉴定核糖核酸的方法; 以及用于鉴定核糖核酸的程序和系统。 如上所述的方法包括：通过使用表示通过串联质谱法获得的各种寡核苷酸的分子量和内部结构数据的片段质谱组来搜索核酸序列数据库对通过化学或酶切割核糖核酸形成的消化的寡核苷酸; 得分候选序列; 在显示最高分数的候选序列中，将显示分数超过阈值的那些指定为鉴定序列; 并使用这些鉴定的序列在包括基因组序列的核酸序列数据库上进行测绘。

    Methods for rapid forensic DNA analysis
    13.
    发明授权
    Methods for rapid forensic DNA analysis 有权
    快速法医DNA分析方法

    公开(公告)号：US08871471B2

    公开(公告)日：2014-10-28

    申请号：US12528282

    申请日：2008-02-25

    申请人： Thomas A. Hall ,  Steven A. Hofstadler ,  Kristin Sannes-Lowery

    发明人： Thomas A. Hall ,  Steven A. Hofstadler ,  Kristin Sannes-Lowery

    IPC分类号： C12P19/34 ,  C12Q1/68

    CPC分类号： C12Q1/6872

    摘要： The present invention provides methods and primer pairs for rapid, high-resolution forensic analysis of DNA and STR-typing by using amplification and mass spectrometry, determining the molecular masses and calculating base compositions of amplification products and comparing the molecular masses with the molecular masses of theoretical amplicons indexed in a database.

    摘要翻译： 本发明提供用于通过使用扩增和质谱法快速，高分辨率的DNA和STR分型法医分析的方法和引物对，确定扩增产物的分子量和计算基础组成，并将分子量与分子质量 在数据库中索引的理论扩增子。

    System and methods for determining molecules using mass spectrometry and related techniques
    14.
    发明授权
    System and methods for determining molecules using mass spectrometry and related techniques 有权
    使用质谱法和相关技术测定分子的系统和方法

    公开(公告)号：US08829432B2

    公开(公告)日：2014-09-09

    申请号：US13848142

    申请日：2013-03-21

    申请人： Brown University

    发明人： Derek M. Stein

    IPC分类号： B01J19/00 ,  C12Q1/00 ,  H01J49/04 ,  B01J19/12 ,  B01D67/00 ,  B01J19/08 ,  C12Q1/68

    CPC分类号： B01J19/087 ,  B01D67/006 ,  B01J19/121 ,  C12Q1/6869 ,  C12Q1/6872 ,  H01J49/0409 ,  C12Q2565/631 ,  C12Q2565/627 ,  C12Q2523/303 ,  C12Q2523/307 ,  C12Q2523/319 ,  C12Q2527/109

    摘要： The present invention generally relates to mass spectrometry and related techniques, and in some cases, to determining single species using mass spectrometry. In certain instances, polymers such as DNA or RNA can also be sequenced. Certain embodiments of the invention relate to passing a polymer, such as DNA, RNA, a protein, a polypeptide, a polysaccharide, etc., through a pore and cleaving the polymer in sequence. For instance, the polymer may be cleaved using a laser or an electric field. In some embodiments, a property of at least one subunit of a polymer is determined using mass spectrometry. In some embodiments, a single ion (which may be a subunit of a polymer, or an ion based on another species) can be isolated in a mass spectrometer and a signal generated from the single ion.

    摘要翻译： 本发明一般涉及质谱法和相关技术，在某些情况下，使用质谱法测定单一物质。 在某些情况下，聚合物如DNA或RNA也可以测序。 本发明的某些实施方案涉及使聚合物如DNA，RNA，蛋白质，多肽，多糖等通过孔并依次切割聚合物。 例如，可以使用激光或电场来切割聚合物。 在一些实施方案中，使用质谱测定聚合物的至少一个亚基的性质。 在一些实施方案中，可以在质谱仪中分离单个离子（其可以是聚合物的亚单位或基于另一物质的离子）和从单一离子产生的信号。

    System and methods for determining molecules using mass spectrometry and related techniques
    19.
    发明授权
    System and methods for determining molecules using mass spectrometry and related techniques 有权
    使用质谱法和相关技术测定分子的系统和方法

    公开(公告)号：US08426807B2

    公开(公告)日：2013-04-23

    申请号：US13056755

    申请日：2009-07-30

    申请人： Derek M. Stein

    发明人： Derek M. Stein

    IPC分类号： G01N33/559 ,  C12Q1/68

    CPC分类号： B01J19/087 ,  B01D67/006 ,  B01J19/121 ,  C12Q1/6869 ,  C12Q1/6872 ,  H01J49/0409 ,  C12Q2565/631 ,  C12Q2565/627 ,  C12Q2523/303 ,  C12Q2523/307 ,  C12Q2523/319 ,  C12Q2527/109

    摘要： The present invention generally relates to mass spectrometry and related techniques, and in some cases, to determining single species using mass spectrometry. In certain instances, polymers such as DNA or RNA can also be sequenced. Certain embodiments of the invention relate to passing a polymer, such as DNA, RNA, a protein, a polypeptide, a polysaccharide, etc., through a pore and cleaving the polymer in sequence. For instance, the polymer may be cleaved using a laser or an electric field. In some embodiments, a property of at least one subunit of a polymer is determined using mass spectrometry. In some embodiments, a single ion (which may be a subunit of a polymer, or an ion based on another species) can be isolated in a mass spectrometer and a signal generated from the single ion.

    摘要翻译： 本发明一般涉及质谱法和相关技术，在某些情况下，使用质谱法测定单一物质。 在某些情况下，聚合物如DNA或RNA也可以测序。 本发明的某些实施方案涉及使聚合物如DNA，RNA，蛋白质，多肽，多糖等通过孔并依次切割聚合物。 例如，可以使用激光或电场来切割聚合物。 在一些实施方案中，使用质谱测定聚合物的至少一个亚基的性质。 在一些实施方案中，可以在质谱仪中分离单个离子（其可以是聚合物的亚单位或基于另一物质的离子）和从单一离子产生的信号。