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    Combinatorial Affinity Selection
    6.
    发明申请
    Combinatorial Affinity Selection 有权
    组合亲和度选择

    公开(公告)号：US20120157325A1

    公开(公告)日：2012-06-21

    申请号：US13399543

    申请日：2012-02-17

    申请人： Stephen P.A. Fodor

    发明人： Stephen P.A. Fodor

    IPC分类号： C40B20/00

    CPC分类号： C12Q1/6809 ,  C12Q2565/515 ,  C12Q2563/149

    摘要： In one aspect of the invention, methods for analyzing nucleic acid sample are provided. In a preferred embodiment, nucleic acids are selected using affinity matrices prior hybridization with a microarray.

    摘要翻译： 在本发明的一个方面，提供了分析核酸样品的方法。 在优选的实施方案中，使用亲和基质在与微阵列进行杂交之前选择核酸。

    Methods for Genotyping Selected Polymorphism
    7.
    发明申请
    Methods for Genotyping Selected Polymorphism 有权
    基因分型选择多态性的方法

    公开(公告)号：US20110009294A1

    公开(公告)日：2011-01-13

    申请号：US12326596

    申请日：2008-12-02

    申请人： Keith W. Jones ,  Michael H. Shapero ,  Stephen P.A. Fodor

    发明人： Keith W. Jones ,  Michael H. Shapero ,  Stephen P.A. Fodor

    IPC分类号： C40B40/06

    CPC分类号： C12Q1/6827 ,  C12Q1/6809 ,  C12Q1/6837 ,  C12Q1/6855 ,  C12Q2600/156

    摘要： Methods for genotyping polymorphisms using a locus specific primer that is complementary to a region near a selected polymorphism are described. Methods for synthesizing pools of locus specific primers that incorporate some degenerate positions are also disclosed. A plurality of different sequence capture probes are synthesized simultaneously using degenerate oligonucleotide synthesis. The sequence of the locus specific regions of the capture probes are related in that they have some bases that are identical in each sequence in the plurality of sequences and positions that vary from one locus specific region to another. The sequences are selected based on proximity to a polymorphism of interest and because they conform to a similar sequence pattern.

    摘要翻译： 描述使用与选定多态性附近的区域互补的位点特异性引物进行基因分型多态性的方法。 还公开了合并含有一些退化位置的基因座特异性引物库的方法。 使用简并寡核苷酸合成同时合成多个不同的序列捕获探针。 捕获探针的基因座特异性区域的序列是相关的，因为它们具有在从一个基因座特异性区域到另一个基因座特异性区域变化的多个序列和位置中的每个序列中具有相同的一些碱基。 基于与感兴趣的多态性的接近度并且因为它们符合类似的序列模式来选择序列。

    Digital Counting of Individual Molecules by Stochastic Attachment of Diverse Label-Tags
    9.
    发明申请
    Digital Counting of Individual Molecules by Stochastic Attachment of Diverse Label-Tags 有权
    通过随机附加不同标签标签对个体分子的数字计数

    公开(公告)号：US20130116130A1

    公开(公告)日：2013-05-09

    申请号：US13327526

    申请日：2011-12-15

    申请人： Glenn K. Fu ,  Stephen P.A. Fodor

    发明人： Glenn K. Fu ,  Stephen P.A. Fodor

    IPC分类号： C12Q1/68

    CPC分类号： C12Q1/6837 ,  C12Q1/6809 ,  C12Q1/6869 ,  C12Q1/6874 ,  C12Q2525/191 ,  C12Q2537/157 ,  C12Q2537/16 ,  C12Q2565/102

    摘要： Compositions, methods and kits are disclosed for high-sensitivity counting of individual molecules by stochastic labeling of a identical molecules in mixtures of molecules by attachment of a unique label-tags from a diverse pool of label tags to confer uniqueness to otherwise identical or indistinguishable events. Individual occurrences of target molecules randomly choose from a non-depleting reservoir of diverse label-tags. Labeled molecules may be detected by hybridization or sequencing based methods. Molecules that would otherwise be identical in information content are labeled to create a separately detectable product that can be distinctly detected. The disclosed stochastic transformation methods reduce the problem of counting molecules from one of locating and identifying identical molecules to a series of binary digital questions detecting whether preprogrammed label-tags are present. The methods may be used, for example, to count a given species of molecule within a sample.

    摘要翻译： 公开了组合物，方法和试剂盒，用于通过从不同标签标签池中附加独特的标签标签随机标记分子混合物中的相同分子来对各个分子进行高灵敏度计数，以赋予其他相同或不可区分的事件的唯一性 。 从各种标签标签的非消耗性储层中随机选择目标分子的个体出现。 标记的分子可以通过杂交或基于测序的方法来检测。 否则在信息内容中相同的分子被标记以产生可以被清楚地检测到的可单独检测的产物。 所公开的随机转换方法减少了将分子从定位和识别相同分子之一计数到检测是否存在预编程标签标签的一系列二进制数字问题的问题。 该方法可以用于例如计数样品中的给定种类的分子。

    Combinatorial Affinity Selection
    10.
    发明申请
    Combinatorial Affinity Selection 审中-公开
    组合亲和度选择

    公开(公告)号：US20110028342A1

    公开(公告)日：2011-02-03

    申请号：US12905264

    申请日：2010-10-15

    申请人： Stephen P.A. Fodor

    发明人： Stephen P.A. Fodor

    IPC分类号： C40B30/04

    CPC分类号： C12Q1/6809 ,  C12Q2565/515 ,  C12Q2563/149

    摘要： In one aspect of the invention, methods for analyzing nucleic acid sample are provided. In a preferred embodiment, nucleic acids are selected using affinity matrices prior hybridization with a microarray.

    摘要翻译： 在本发明的一个方面，提供了分析核酸样品的方法。 在优选的实施方案中，使用亲和基质在与微阵列进行杂交之前选择核酸。