公开(公告)号：US20050095595A1

公开(公告)日：2005-05-05

申请号：US10696177

申请日：2003-10-29

申请人： Richard Pittaro ,  Douglas Amorese ,  Carol Schembri ,  Leslie Leonard ,  Nicholas Sampas ,  Michael Caren

发明人： Richard Pittaro ,  Douglas Amorese ,  Carol Schembri ,  Leslie Leonard ,  Nicholas Sampas ,  Michael Caren

IPC分类号： C12Q1/68

CPC分类号： C12Q1/6837 ,  C12Q2545/101

摘要： Systems and methods for optimizing polymer analysis are provided. One such system includes a polymer analysis system having a polymer control system. The polymer analysis system is operative to: apply a set of conditions to a sample being analyzed by the polymer array, the set of conditions correspond to at least one characteristic of the polymer array; analyze the at least one characteristic using the polymer control system; and generate polymer array data.

摘要翻译： 提供了优化聚合物分析的系统和方法。 一种这样的系统包括具有聚合物控制系统的聚合物分析系统。 聚合物分析系统可操作以：将一组条件应用于由聚合物阵列分析的样品，该组条件对应于聚合物阵列的至少一个特性; 使用聚合物控制系统分析至少一个特征; 并生成聚合物阵列数据。

公开(公告)号：US20050026154A1

公开(公告)日：2005-02-03

申请号：US10633609

申请日：2003-07-31

申请人： Laurakay Bruhn ,  Douglas Amorese ,  Michael Caren ,  Leslie Leonard ,  Richard Pittaro ,  Carol Schembri ,  Peter Webb ,  Paul Wolber

发明人： Laurakay Bruhn ,  Douglas Amorese ,  Michael Caren ,  Leslie Leonard ,  Richard Pittaro ,  Carol Schembri ,  Peter Webb ,  Paul Wolber

IPC分类号： B01J19/00 ,  B01L3/00 ,  C12Q1/68 ,  C40B40/06 ,  G01N21/25 ,  G01N33/48 ,  G01N33/483 ,  G01N33/50 ,  G01N33/53 ,  G01N33/58 ,  G06F19/00

CPC分类号： B01L3/545 ,  B01J2219/00662 ,  B01J2219/00693 ,  B01J2219/00722 ,  B01L3/5088 ,  B01L2200/025 ,  B01L2300/024 ,  B01L2300/0819 ,  C40B40/06 ,  G01N21/253

摘要： A method of using a chemical array unit having a chemical array with probes at multiple feature locations. A request for test may be read, which test uses a sub-array of the array. A pattern of the sub-array may be retrieved from a memory using the test request, which memory carries a pattern for the sub-array which is retrievable with the different test request. Also, a method of reading a chemical array unit which has been exposed to a sample, and feature locations of which have been rendered incapable of providing signal data representative of binding of a sample component. Further methods, apparatus, and computer program products are provided.

摘要翻译： 一种在多个特征位置使用具有化学阵列的化学阵列单元和探针的方法。 可以读取测试请求，哪个测试使用数组的子阵列。 可以使用测试请求从存储器检索子阵列的模式，该存储器携带用于使用不同测试请求可检索的子阵列的模式。 此外，读取已经暴露于样品的化学阵列单元的方法，其特征位置已经不能提供表示样品组分的结合的信号数据。 提供其他方法，装置和计算机程序产品。

公开(公告)号：US20050147975A1

公开(公告)日：2005-07-07

申请号：US10746871

申请日：2003-12-24

申请人： Carol Schembri ,  Leslie Leonard

发明人： Carol Schembri ,  Leslie Leonard

IPC分类号： C12P19/34 ,  C12Q1/68

CPC分类号： C12Q1/6865

摘要： Methods for amplifying RNA from genomic DNA are provided. In the subject methods, a promoter-primer having a primer domain linked to an RNA polymerase promoter domain is first annealed to genomic DNA. The primer domain of the resultant annealed promoter-primer/genomic DNA complex is then extended to produce a double-stranded DNA molecule that has an RNA polymerase promoter domain. The resultant double-stranded DNA molecule is then transcribed into RNA product, e.g., labeled RNA product, using an RNA polymerase that is able to transcribe through the gap between the 5′ terminus of the promoter domain and the 3′ side of the genomic template. The subject methods find use a variety of different applications in which the preparation of amplified amounts of RNA from a genomic template is desired, where the amplification may be linear or geometric and may amplify the entire genome or only a select portion thereof. Also provided are kits for practicing the subject methods.

摘要翻译： 提供了从基因组DNA扩增RNA的方法。 在本方法中，首先将与RNA聚合酶启动子结构域连接的引物结构域的启动子 - 引物退火至基因组DNA。 然后将所得退火的启动子 - 引物/基因组DNA复合物的引物结构域延伸以产生具有RNA聚合酶启动子结构域的双链DNA分子。 然后将得到的双链DNA分子转录成RNA产物，例如标记的RNA产物，使用能够通过启动子结构域的5'末端和基因组模板的3'侧之间的间隙转录的RNA聚合酶 。 本发明方法发现使用各种不同的应用，其中需要从基因组模板制备扩增量的RNA，其中扩增可以是线性的或几何的，并且可以扩增整个基因组或仅扩增其选择部分。 还提供了用于实践主题方法的工具包。

公开(公告)号：US20070202008A1

公开(公告)日：2007-08-30

申请号：US11364267

申请日：2006-02-28

申请人： Carol Schembri ,  May Tom-Moy

发明人： Carol Schembri ,  May Tom-Moy

IPC分类号： G01N21/00

CPC分类号： G01N33/92 ,  G01N33/48721 ,  G01N33/5438

摘要： Systems and methods for nanopore flow cells are provided.

摘要翻译： 提供了纳米孔流动池的系统和方法。

公开(公告)号：US20070081155A1

公开(公告)日：2007-04-12

申请号：US11214498

申请日：2005-08-30

申请人： Carol Schembri ,  Zhenghua Ji ,  Hongfeng Yin ,  William McAllister

发明人： Carol Schembri ,  Zhenghua Ji ,  Hongfeng Yin ,  William McAllister

IPC分类号： G01N1/10 ,  B01L3/02

CPC分类号： G01N35/10 ,  B01L3/0275 ,  B01L3/5021 ,  B01L3/508 ,  B01L2300/0654 ,  B01L2300/0681 ,  B01L2300/0838 ,  B01L2400/0406 ,  G01N21/03 ,  G01N2035/1034 ,  G01N2035/1053 ,  G01N2035/1055 ,  G01N2035/1062

摘要： The present invention relates to an apparatus for handling a liquid sample, wherein the apparatus includes integrated sample processing and sample evaluating components.

摘要翻译： 本发明涉及一种用于处理液体样品的设备，其中该设备包括集成的样品处理和样品评估组件。

公开(公告)号：US20050084866A1

公开(公告)日：2005-04-21

申请号：US10687277

申请日：2003-10-15

申请人： Michael Caren ,  Carol Schembri

发明人： Michael Caren ,  Carol Schembri

IPC分类号： B01F11/00 ,  B01F13/00 ,  B01L3/00 ,  G01N1/10 ,  C12Q1/68

CPC分类号： B01F11/0071 ,  B01F13/0059 ,  B01L3/50273 ,  B01L2300/0636 ,  B01L2300/0825 ,  B01L2400/0481 ,  Y10T436/2575

摘要： Apparatus and methods for mixing fluids are disclosed. An apparatus comprises a housing or channel having an interior with capillary dimensions and a pressure activated mechanism in fluid communication with the interior. The pressure activated mechanism is activatable to cause motion of fluid in the interior of the housing thereby mixing the fluid in the interior. An apparatus may comprise an activating mechanism for activating the pressure activated mechanism. Typically, at least a portion of the interior of the housing comprises a linear array of features for conducting chemical reactions. Optionally, an apparatus comprises a fluid dispensing device.

摘要翻译： 公开了用于混合流体的装置和方法。 一种装置包括具有毛细管尺寸内部和与内部流体连通的压力启动机构的壳体或通道。 压力激活机构可激活以引起壳体内部的流体的运动，从而将流体混合在内部。 设备可以包括用于启动压力启动机构的启动机构。 通常，壳体内部的至少一部分包括用于进行化学反应的线性阵列的特征。 可选地，装置包括流体分配装置。

公开(公告)号：US20070020146A1

公开(公告)日：2007-01-25

申请号：US11171091

申请日：2005-06-29

申请人： James Young ,  Carol Schembri

发明人： James Young ,  Carol Schembri

IPC分类号： G01N27/00

CPC分类号： B81C1/00087 ,  B81B2203/0353 ,  B82Y15/00 ,  G01N33/48721

摘要： A nanopore structure for conducting analysis on a molecule in solution. The nanopore structure includes an electrically insulating substrate and a membrane contacting the electrically insulating substrate. A nanopore is defined through the electrically insulating substrate and the membrane for conducting analysis on a molecule being positioned in the nanopore. Also disclosed are methods for making and using the nanopore structures.

摘要翻译： 用于对溶液中的分子进行分析的纳米孔结构。 纳米孔结构包括电绝缘基底和接触电绝缘基底的膜。 通过电绝缘衬底和膜定义纳米孔，用于在位于纳米孔中的分子上进行分析。 还公开了制备和使用纳米孔结构的方法。

公开(公告)号：US20050250129A1

公开(公告)日：2005-11-10

申请号：US11041129

申请日：2005-01-21

申请人： Carol Schembri ,  Leslie Overman ,  Charles Hotz

发明人： Carol Schembri ,  Leslie Overman ,  Charles Hotz

IPC分类号： B01F9/00 ,  B01F13/00 ,  C07H21/00 ,  C12M1/34 ,  C12P19/34 ,  C12Q1/68 ,  G01N33/543

CPC分类号： C07H21/00 ,  B01F9/002 ,  B01F13/005 ,  B01F13/0054 ,  B01F13/0059 ,  C07B2200/11 ,  C12Q1/6876 ,  G01N33/54393 ,  Y10T436/143333

摘要： The invention provides an apparatus and method for conducting chemical or biochemical reactions on a solid surface within an enclosed chamber. The invention may be used in conducting hybridization reactions, as of biopolymers such as DNA, RNA, oligonucleotides, peptides, polypeptides, proteins, antibodies, and the like. In another aspect, the invention provides an improved method for mixing a thin film of solution, as in a hybridization chamber. The invention further provides a kit for carrying out the methods of the invention.

摘要翻译： 本发明提供了用于在封闭室内的固体表面上进行化学或生化反应的装置和方法。 本发明可用于进行杂交反应，如生物聚合物如DNA，RNA，寡核苷酸，肽，多肽，蛋白质，抗体等。 另一方面，本发明提供了一种混合溶液薄膜的改进方法，如在杂交室中。 本发明还提供了一种用于实施本发明方法的试剂盒。

公开(公告)号：US20050191700A1

公开(公告)日：2005-09-01

申请号：US11119059

申请日：2005-04-28

申请人： Carol Schembri

发明人： Carol Schembri

IPC分类号： B01J19/00 ,  C07B61/00 ,  C07H21/00 ,  C12Q1/68 ,  B05D3/00 ,  C12P19/34

CPC分类号： B01J19/0046 ,  B01J2219/00274 ,  B01J2219/00497 ,  B01J2219/00527 ,  B01J2219/00531 ,  B01J2219/00533 ,  B01J2219/00536 ,  B01J2219/00585 ,  B01J2219/00596 ,  B01J2219/00653 ,  B01J2219/00659 ,  B01J2219/00675 ,  B01J2219/00722 ,  B01J2219/00725 ,  B01J2219/00731 ,  B82Y30/00 ,  C07B2200/11 ,  C07H21/00 ,  C40B40/00 ,  Y10T436/143333

摘要： Methods and compositions are provided for producing arrays of polymeric binding agents. In the subject methods, the individual polymers of the array are synthesized using solid phase synthesis techniques on the surface of a substrate. A critical feature of the invention is that one or more locations on the substrate surface are spatially and temporally protected by a protective bubble during the synthesis protocol, where the protective bubble may be produced using any convenient bubble producing means. The bubble producing means may be a component of either a substrate or a structure separate from the substrate. Also provided are the arrays produced by the subject methods, kits for use in practicing the subject methods, and methods of using the arrays in analyte detection assays, including hybridization assays, such as gene discovery, differential gene expression and gene sequencing assays.

公开(公告)号：US20050083781A1

公开(公告)日：2005-04-21

申请号：US10687276

申请日：2003-10-15

申请人： Michael Caren ,  Carol Schembri

发明人： Michael Caren ,  Carol Schembri

IPC分类号： B01F5/06 ,  B01F13/00 ,  B01F15/02 ,  B01L3/00 ,  C40B60/14 ,  G01N35/00 ,  G01N35/04 ,  B01F9/10

CPC分类号： B01F15/0201 ,  B01F5/061 ,  B01F13/0059 ,  B01F15/0233 ,  B01F2005/0621 ,  B01F2005/0636 ,  B01F2215/0431 ,  B01J2219/00326 ,  B01J2219/0052 ,  B01J2219/00657 ,  B01J2219/00702 ,  B01L3/50273 ,  B01L2200/10 ,  B01L2300/0636 ,  B01L2300/0806 ,  B01L2300/0867 ,  B01L2400/0409 ,  B01L2400/0688 ,  B01L2400/086 ,  C40B60/14 ,  G01N2035/00237 ,  G01N2035/0449 ,  Y10S366/01 ,  Y10S366/03

摘要： An apparatus for mixing fluids comprises a housing having at least a portion of its interior, for example, a channel, with capillary dimensions and at least one structural member in the interior adjacent an end of the channel. The dimensions of and placement of the structural member are sufficient such that intermittent application of centrifugal force to the interior of the housing causes movement of the fluid therein. The housing may comprise a mixing chamber or area that is in fluid communication with the interior. The apparatus may comprise a mechanism adapted to generate centrifugal force within the housing to cause movement of fluid in the interior of the housing without exit of fluid therefrom.

摘要翻译： 用于混合流体的装置包括壳体，其具有其内部的至少一部分，例如具有毛细管尺寸的通道，并且在内部中的至少一个结构构件邻近通道的端部。 结构构件的尺寸和放置是足够的，使得将离心力间歇地施加到壳体内部导致其中的流体的移动。 壳体可以包括与内部流体连通的混合室或区域。 该装置可以包括适于在壳体内产生离心力的机构，以引起流体在壳体内部的移动而不从其流出流体。