公开(公告)号：US20050181379A1

公开(公告)日：2005-08-18

申请号：US10781238

申请日：2004-02-18

申请人： Xing Su ,  Narayanan Sundararajan ,  Tae-Woong Koo

发明人： Xing Su ,  Narayanan Sundararajan ,  Tae-Woong Koo

IPC分类号： B01L3/00 ,  C12N15/10 ,  C12Q1/68 ,  C12P19/34 ,  G01N33/53

CPC分类号： C12N15/1006 ,  B01L3/5027 ,  C12Q1/6869 ,  C12Q2565/518

摘要： The disclosed methods and devices provides a method and device for isolating and positioning a single polymer molecule, such as a nucleic acid strand, for sequencing, and a method for manufacturing such a device. The method and device can be used for sequencing individual polymer molecules, such as ribonucleic acid (RNA) or deoxyribonucleic acid (DNA).

摘要翻译： 所公开的方法和装置提供了用于分离和定位用于测序的单个聚合物分子例如核酸链的方法和装置，以及用于制造这种装置的方法。 该方法和装置可用于测序单个聚合物分子，例如核糖核酸（RNA）或脱氧核糖核酸（DNA）。

公开(公告)号：US20050148098A1

公开(公告)日：2005-07-07

申请号：US10749528

申请日：2003-12-30

申请人： Xing Su ,  Lei Sun ,  Mineo Yamakawa ,  Tae-Woong Koo ,  Selena Chan ,  Andrew Berlin ,  Narayanan Sundararajan

发明人： Xing Su ,  Lei Sun ,  Mineo Yamakawa ,  Tae-Woong Koo ,  Selena Chan ,  Andrew Berlin ,  Narayanan Sundararajan

IPC分类号： G01N21/65 ,  G01N33/58 ,  G01N33/68 ,  G06F19/00 ,  G01N33/48 ,  G01N33/50 ,  G01N33/543 ,  G01N33/553

CPC分类号： G01N21/658 ,  G01N33/6803 ,  G01N2021/653 ,  G01N2021/655 ,  G01N2021/656

摘要： The invention provides methods for analyzing the protein content of a biological sample, for example to obtain a protein profile of a sample provided by a particular individual. The proteins and protein fragments in the sample are separated on the basis of chemical and/or physical properties and maintained in a separated state at discrete locations on a solid substrate or within a stream of flowing liquid. Raman spectra are then detected as produced by the separated proteins or fragments at the discrete locations such that a spectrum from a discrete location provides information about the structure or identity of one or more particular proteins or fragments at the discrete location. The proteins or fragments at discrete locations can be coated with a metal, such as gold or silver, and/or the separated proteins can be contacted with a chemical enhancer to provide SERS spectra. Method and kits for practicing the invention are also provided.

摘要翻译： 本发明提供了用于分析生物样品的蛋白质含量的方法，例如获得由特定个体提供的样品的蛋白质谱。 样品中的蛋白质和蛋白质片段基于化学和/或物理性质分离，并在固体基质上或流动液体流中的离散位置保持分离状态。 然后检测拉曼光谱，由离散位置处的分离的蛋白质或片段产生，使得离散位置的光谱提供关于在离散位置处的一种或多种特定蛋白质或片段的结构或身份的信息。 离散位置处的蛋白质或片段可以用金属（例如金或银）涂覆，和/或分离的蛋白质可与化学增强剂接触以提供SERS光谱。 还提供了用于实施本发明的方法和试剂盒。

公开(公告)号：US5804684A

公开(公告)日：1998-09-08

申请号：US519039

申请日：1995-08-24

申请人： Xing Su

发明人： Xing Su

IPC分类号： B01L3/00 ,  C12N15/10 ,  C07H21/00

CPC分类号： B01L3/502753 ,  C12N15/1006 ,  C12N15/1013 ,  B01L2200/0631 ,  B01L2300/069 ,  B01L2400/0406

摘要： The invention features a method of isolating nucleic acid in a substantially purified form, including the steps of: a) contacting a biological sample which contains aggregated nucleic acid with a matrix comprising a solid hydrophilic organic polymer without an effective positive charge under conditions which permit the nucleic acid to bind to the matrix; and b) recovering nucleic acid from the matrix.

摘要翻译： 本发明的特征在于以基本纯化的形式分离核酸的方法，包括以下步骤：a）使含有聚集核酸的生物样品与包含固体亲水性有机聚合物的基质在没有有效正电荷的条件下接触，条件允许 核酸结合基质; 和b）从基质中回收核酸。

公开(公告)号：US20160245774A1

公开(公告)日：2016-08-25

申请号：US15144591

申请日：2016-05-02

申请人： Noureddine Tayebi ,  Xing Su ,  Handong Li

发明人： Noureddine Tayebi ,  Xing Su ,  Handong Li

IPC分类号： G01N27/327 ,  C23C16/00

CPC分类号： G01N27/3278 ,  C23C16/00

摘要： Highly selective coated-electrode nanogap transducers for the detection of redox molecules are described. In an example, an analyte detection system includes one or more transducer electrodes having a surface for analyte detection. The surface includes a coating to inhibit direct contact of analyte with the surface of the one or more transducer electrodes.

摘要翻译： 描述了用于检测氧化还原分子的高选择性涂层电极纳米胶片转换器。 在一个示例中，分析物检测系统包括具有用于分析物检测的表面的一个或多个换能器电极。 表面包括抑制分析物与一个或多个换能器电极的表面的直接接触的涂层。

公开(公告)号：US08962279B2

公开(公告)日：2015-02-24

申请号：US12655459

申请日：2009-12-30

申请人： David J. Liu ,  Xing Su ,  Kai Wu

发明人： David J. Liu ,  Xing Su ,  Kai Wu

IPC分类号： C12P19/34 ,  C12M1/00 ,  C12Q1/48 ,  C12Q1/68 ,  G01N27/414

CPC分类号： C12Q1/48 ,  C12Q1/6837 ,  C12Q1/6869 ,  G01N27/4145 ,  G01N2333/9125 ,  C12Q2565/607 ,  C12Q2565/507 ,  C12Q2565/301

摘要： Methods for sequencing nucleic acids are presented. Sequencing is accomplished through the chemical amplification of the products of DNA synthesis and the detection of the chemically amplified products. In embodiments of the invention, a substrate is provided having a plurality of molecules of DNA to be sequenced attached and a plurality of molecules capable of chelating pyrophosphate ions attached, the DNA molecules to be sequenced are primed, and a next complementary nucleotide is incorporated and excised a plurality of times leading to the buildup of pyrophosphate ions locally around the DNA molecule to be sequenced. Pyrophosphate ions are captured by the substrate-attached chelators and electronically detected to determine the identity of the next complementary nucleic acid in the DNA molecule to be sequenced. Additionally, devices and methods are provided for detecting biomolecules through the detection of pyrophosphate ions.

摘要翻译： 介绍了核酸测序方法。 通过化学扩增DNA合成产物和化学扩增产物的检测来完成测序。 在本发明的实施方案中，提供了具有多个待测序的DNA分子的底物和能够螯合连接的焦磷酸根离子的多个分子，引入待测序的DNA分子，并且掺入下一个互补核苷酸， 切除多次导致待测序的DNA分子局部周围的焦磷酸盐离子的积聚。 焦磷酸根离子被底物连接的螯合剂捕获并电子检测以确定待测序的DNA分子中下一个互补核酸的同一性。 另外，提供了通过检测焦磷酸根离子来检测生物分子的装置和方法。

公开(公告)号：US20140342470A1

公开(公告)日：2014-11-20

申请号：US14448141

申请日：2014-07-31

申请人： Xing Su ,  David J. Liu ,  Kai Wu ,  Kenneth B. Swartz ,  Mineo Yamakawa

发明人： Xing Su ,  David J. Liu ,  Kai Wu ,  Kenneth B. Swartz ,  Mineo Yamakawa

IPC分类号： G01N1/40

CPC分类号： G01N1/4044 ,  B01L3/502761 ,  B01L3/502784 ,  B01L2200/0647 ,  B01L2200/0673 ,  B01L2300/0816 ,  B01L2400/0424 ,  B01L2400/043 ,  B01L2400/0638 ,  B01L2400/086 ,  G01N35/0098 ,  G01N35/08 ,  G01N2015/0038 ,  G01N2015/0092 ,  H01F7/20 ,  H01F7/206 ,  H01F2007/068 ,  Y10S436/805 ,  Y10S436/806 ,  Y10T29/49117 ,  Y10T29/4913 ,  Y10T29/49155 ,  Y10T436/25

摘要： An embodiment of the invention relates to a device for detecting an analyte in a sample. The device comprises a fluidic network and an integrated circuitry component. The fluidic network comprises a sample zone, a cleaning zone and a detection zone. The fluidic network contains a magnetic particle and/or a signal particle. A sample containing an analyte is introduced, and the analyte interacts with the magnetic particle and/or the signal particle through affinity agents. A microcoil array or a mechanically movable permanent magnet is functionally coupled to the fluidic network, which are activatable to generate a magnetic field within a portion of the fluidic network, and move the magnetic particle from the sample zone to the detection zone. A detection element is present which detects optical or electrical signals from the signal particle, thus indicating the presence of the analyte.

摘要翻译： 本发明的一个实施例涉及用于检测样品中的分析物的装置。 该装置包括流体网络和集成电路部件。 流体网络包括样品区，清洁区和检测区。 流体网络包含磁性颗粒和/或信号颗粒。 引入含有分析物的样品，并且分析物通过亲和试剂与磁性颗粒和/或信号颗粒相互作用。 微线圈阵列或机械可移动永磁体在功能上耦合到流体网络，流体网络可激活以在流体网络的一部分内产生磁场，并将磁性颗粒从样品区域移动到检测区域。 存在检测元件，其检测来自信号颗粒的光学或电信号，从而指示分析物的存在。

公开(公告)号：US20140299485A1

公开(公告)日：2014-10-09

申请号：US14267327

申请日：2014-05-01

申请人： Jonathan S. Daniels ,  Oguz H. Elibol ,  Grace M. Credo ,  Xing Su

发明人： Jonathan S. Daniels ,  Oguz H. Elibol ,  Grace M. Credo ,  Xing Su

IPC分类号： G01N27/22

CPC分类号： G01N27/3277 ,  B82Y30/00 ,  C12Q1/68 ,  G01D5/24 ,  G01K7/34 ,  G01L1/14 ,  G01N27/22 ,  G01R27/26 ,  G06K7/08

摘要： Described herein is a device comprising a plurality of first reaction electrodes arranged in an array, the plurality of first reaction electrodes configured to be exposed to a solution and having a capacitance; first circuitry configured to controllably connect the plurality of first reaction electrodes to a bias source and controllably disconnect the plurality of first reaction electrodes from the bias source; and second circuitry configured to measure a rate of charging or discharging of the capacitance. Also described herein is a method of using this device to sequence DNA.

摘要翻译： 这里描述的是一种装置，其包括排列成阵列的多个第一反应电极，多个第一反应电极构造为暴露于溶液并具有电容; 第一电路，被配置为将多个第一反应电极可控地连接到偏置源并且可控制地将多个第一反应电极与偏置源分离; 以及第二电路，被配置为测量电容的充电或放电速率。 本文还描述了使用该装置来对DNA进行序列化的方法。

公开(公告)号：US08715932B2

公开(公告)日：2014-05-06

申请号：US12860462

申请日：2010-08-20

申请人： Xing Su ,  Kai Wu ,  Liming Wang ,  Jianquan Liu ,  Grace M. Credo

发明人： Xing Su ,  Kai Wu ,  Liming Wang ,  Jianquan Liu ,  Grace M. Credo

IPC分类号： C12Q1/68

CPC分类号： C12Q1/6874 ,  C12Q2531/125 ,  C12Q2535/122 ,  C12Q2565/301 ,  C12Q2565/607

摘要： Nucleic acid sequencing using concatemers of DNA is provided. Optionally, amplified reaction products from the repeated incorporation and excision of a nucleoside complementary to a nucleoside of the DNA to be sequenced onto primer molecules hybridized to the concatemers of DNA are detected. Nucleic acid sequencing using concatemers of DNA and non-natural oligonucleotides is also provided. Nucleic acid sequencing reactions are detected electronically and or optically using arrays of detectors.

摘要翻译： 提供使用DNA连接子的核酸测序。 任选地，检测来自重复掺入和切除与待测序的DNA的核苷互补的核苷酸的扩增反应产物与DNA连接体杂交的引物分子上。 还提供了使用DNA和非天然寡核苷酸的并联体的核酸测序。 使用检测器阵列电子和/或光学检测核酸测序反应。

公开(公告)号：US08674086B2

公开(公告)日：2014-03-18

申请号：US12823995

申请日：2010-06-25

申请人： Jianquan Liu ,  Xing Su ,  Kai Wu

发明人： Jianquan Liu ,  Xing Su ,  Kai Wu

IPC分类号： C07H19/20 ,  C07H19/00 ,  C07H19/04

CPC分类号： C07H19/10 ,  C12Q1/6874 ,  C12Q2521/101 ,  C12Q2521/319 ,  C12Q2521/525 ,  C12Q2525/186 ,  C12Q2537/157 ,  C12Q2565/537 ,  C12Q2565/607

摘要： Embodiments of the invention provide non-natural bifunctional nucleotides having both nuclease resistance and nucleic acid synthesis blocking properties and methods of sequencing nucleic acids that employ non-natural bifunctional nucleic acids. Additional embodiments provide non-natural oligonucleotides and methods for sequencing nucleic acids using the non-natural oligonucleotides. Methods according to embodiments of the invention employ electronic detection and fluorescent detection of nucleic acid sequencing reactions.

摘要翻译： 本发明的实施方案提供具有核酸酶抗性和核酸合成阻断性质的非天然双功能核苷酸，以及使用非天然双功能核酸测序核酸的方法。 另外的实施方案提供非天然寡核苷酸和使用非天然寡核苷酸测序核酸的方法。 根据本发明的实施方案的方法使用核酸测序反应的电子检测和荧光检测。

公开(公告)号：US20140001055A1

公开(公告)日：2014-01-02

申请号：US13538346

申请日：2012-06-29

申请人： Oguz H. Elibol ,  Grace M. Credo ,  Xing Su ,  Madoo Varma ,  Jonathan S. Daniels ,  Drew Hall ,  Handong Li ,  Noureddine Tayebi ,  Kai Wu

发明人： Oguz H. Elibol ,  Grace M. Credo ,  Xing Su ,  Madoo Varma ,  Jonathan S. Daniels ,  Drew Hall ,  Handong Li ,  Noureddine Tayebi ,  Kai Wu

IPC分类号： G01N27/26 ,  B82Y5/00 ,  B82Y30/00

CPC分类号： G01N27/3277 ,  B01J19/0046 ,  B01J2219/00608 ,  B01J2219/00653 ,  B01J2219/00722 ,  B81B7/04 ,  B81B2201/0214 ,  B81B2201/058 ,  B82Y15/00 ,  C40B20/04 ,  C40B50/16 ,  G01N27/3278 ,  G01N27/4145 ,  G01N27/4146 ,  G01N27/4148

摘要： Various embodiments provide devices, methods, and systems for high throughput biomolecule detection using transducer arrays. In one embodiment, a transducer array made up of transducer elements may be used to detect byproducts from chemical reactions that involve redox genic tags. Each transducer element may include at least a reaction chamber and a fingerprinting region, configured to flow a fluid from the reaction chamber through the fingerprinting region. The reaction chamber can include a molecule attachment region and the fingerprinting region can include at least one set of electrodes separated by a nanogap for conducting redox cycling reactions. In embodiments, by flowing the chamber content obtained from a reaction of a latent redox tagged probe molecule, a catalyst, and a target molecule in the reaction chamber through the fingerprinting region, the redox cycling reactions can be detected to identify redox-tagged biomolecules.

摘要翻译： 各种实施方案提供使用换能器阵列进行高通量生物分子检测的装置，方法和系统。 在一个实施例中，由换能器元件组成的换能器阵列可用于检测涉及氧化还原基因标签的化学反应的副产物。 每个换能器元件可以至少包括反应室和指纹区域，其被配置为使来自反应室的流体通过指纹区域流动。 反应室可以包括分子附着区域，并且指纹区域可以包括由纳米间隙分开的至少一组电极，用于进行氧化还原循环反应。 在实施方案中，通过使反应室中潜氧氧化还原标记的探针分子，催化剂和靶分子的反应通过指纹区域流动所述腔室内容物，可以检测氧化还原循环反应以鉴定氧化还原标记的生物分子。