公开(公告)号：US07857957B2

公开(公告)日：2010-12-28

申请号：US11702417

申请日：2007-02-05

申请人： Jing Cheng ,  Lei Wu ,  Michael J. Heller ,  Edward L. Sheldon ,  Jonathan M. Diver ,  James P. O'Connell ,  Dan Smolko ,  Shila Jalali ,  David Willoughby

发明人： Jing Cheng ,  Lei Wu ,  Michael J. Heller ,  Edward L. Sheldon ,  Jonathan M. Diver ,  James P. O'Connell ,  Dan Smolko ,  Shila Jalali ,  David Willoughby

IPC分类号： G01N27/447 ,  C12N1/06

CPC分类号： C12Q1/24 ,  B01L3/502 ,  B01L2300/0636 ,  B01L2300/0645 ,  B01L2300/0877 ,  B01L2400/0424 ,  B01L2400/0487 ,  G01N21/6428

摘要： We have performed separation of bacterial and cancer cells from peripheral human blood in microfabricated electronic chips by dielectrophoresis. The isolated cells were examined by staining the nuclei with fluorescent dye followed by laser induced fluorescence imaging. We have also released DNA and RNA from the isolated cells electronically and detected specific marker sequences by DNA amplification followed by electronic hybridization to immobilized capture probes. Efforts towards the construction of a “laboratory-on-a-chip” system are presented which involves the selection of DNA probes, dyes, reagents and prototyping of the fully integrated portable instrument.

摘要翻译： 我们通过介电电泳在微细电子芯片中进行细胞和癌细胞与外周血液分离。 通过用荧光染料染色细胞核，然后激光诱导荧光成像来检查分离的细胞。 我们还通过电子方式从分离的细胞中释放DNA和RNA，并通过DNA扩增检测特异性标记序列，然后与固定的捕获探针进行电子杂交。 提出了建立“芯片实验室”系统的努力，其中包括选择DNA探针，染料，试剂和完全集成的便携式仪器的原型。

公开(公告)号：US06309823B1

公开(公告)日：2001-10-30

申请号：US08778794

申请日：1997-01-03

申请人： Maureen T. Cronin ,  Charles G Miyada ,  Earl A. Hubbell ,  Mark Chee ,  Stephen P. A. Fodor ,  Xiaohua C. Huang ,  Robert J. Lipshutz ,  Peter E. Lobban ,  MacDonald S. Morris ,  Edward L. Sheldon

发明人： Maureen T. Cronin ,  Charles G Miyada ,  Earl A. Hubbell ,  Mark Chee ,  Stephen P. A. Fodor ,  Xiaohua C. Huang ,  Robert J. Lipshutz ,  Peter E. Lobban ,  MacDonald S. Morris ,  Edward L. Sheldon

IPC分类号： C12Q168

CPC分类号： B01J19/0046 ,  B01J2219/00432 ,  B01J2219/00529 ,  B01J2219/00605 ,  B01J2219/00608 ,  B01J2219/00612 ,  B01J2219/00617 ,  B01J2219/00626 ,  B01J2219/00644 ,  B01J2219/00659 ,  B01J2219/00711 ,  B01J2219/00722 ,  B82Y30/00 ,  C07B2200/11 ,  C07H21/00 ,  C12Q1/6827 ,  C12Q1/6837 ,  C12Q1/6874 ,  C12Q1/6876 ,  C12Q1/6883 ,  C12Q2600/106 ,  C12Q2600/156 ,  C40B40/06 ,  C40B60/14 ,  C12Q2565/513

摘要： The invention provides arrays of immobilized probes, and methods employing the arrays, for detecting mutations in the biotransformation genes, such as cytochromes P450. For example, one such array comprises four probe sets. A first probe set comprises a plurality of probes, each probe comprising a segment of at least three nucleotides exactly complementary to a subsequence of a reference sequence from a biotransformation gene, the segment including at least one interrogation position complementary to a corresponding nucleotide in the reference sequence. Second, third and fourth probe sets each comprise a corresponding probe for each probe in the first probe set. The probes in the second, third and fourth probe sets are identical to a sequence comprising the corresponding probe from the first probe set or a subsequece of at least three nucleotides thereof that includes the at least one interrogation position, except that the at least one interrogation position is occupied by a different nucleotide in each of the four corresponding probes from the four probe sets.

摘要翻译： 本发明提供了固定化探针的阵列，以及采用该阵列的方法，用于检测生物转化基因如细胞色素P450中的突变。 例如，一个这样的阵列包括四个探针组。 第一探针组包含多个探针，每个探针包含与来自生物转化基因的参考序列的亚序列完全互补的至少三个核苷酸的片段，该片段包含与参考文献中的相应核苷酸互补的至少一个询问位置 序列。 第二，第三和第四探针组各自包括在第一探针组中的每个探针的相应探针。 第二，第三和第四探针组中的探针与包括来自第一探针组的相应探针或其至少包含至少一个询问位置的至少三个核苷酸的子序列的序列相同，除了至少一个询问 位置由来自四个探针组的四个相应探针中的每一个中的不同核苷酸占据。

公开(公告)号：US5412087A

公开(公告)日：1995-05-02

申请号：US874849

申请日：1992-04-24

申请人： Glenn H. McGall ,  Stephen P. A. Fodor ,  Edward L. Sheldon

发明人： Glenn H. McGall ,  Stephen P. A. Fodor ,  Edward L. Sheldon

IPC分类号： B01J19/00 ,  C07B61/00 ,  C07H21/00 ,  C07K1/04 ,  C40B40/06 ,  C40B40/10 ,  C40B60/14 ,  C07H17/00 ,  C12N11/06

CPC分类号： B82Y30/00 ,  B01J19/0046 ,  C07H21/00 ,  C07K1/045 ,  C07K1/047 ,  B01J2219/00364 ,  B01J2219/00367 ,  B01J2219/00369 ,  B01J2219/00378 ,  B01J2219/00389 ,  B01J2219/00416 ,  B01J2219/0043 ,  B01J2219/00432 ,  B01J2219/00475 ,  B01J2219/005 ,  B01J2219/00527 ,  B01J2219/00529 ,  B01J2219/00531 ,  B01J2219/00536 ,  B01J2219/00585 ,  B01J2219/0059 ,  B01J2219/00596 ,  B01J2219/00605 ,  B01J2219/00608 ,  B01J2219/0061 ,  B01J2219/00612 ,  B01J2219/00626 ,  B01J2219/0063 ,  B01J2219/00659 ,  B01J2219/00686 ,  B01J2219/00711 ,  B01J2219/00722 ,  B01J2219/00725 ,  C07B2200/11 ,  C40B40/06 ,  C40B40/10 ,  C40B60/14 ,  Y02P20/55 ,  Y10S530/816

摘要： Substrates with surfaces comprising compounds with thiol functional groups protected with a photoremovable protecting group can be used to construct arrays of immobilized anti-ligands, such as oligonucleotide probes or other biological polymers. The arrays can be used in assays to detect the presence of complementary nucleic acids in a sample. Spatially addressed irradiation of predefined regions on the surface permits immobilization of oligonucleotides and other biological polymers at the activated regions on the surface. Cycles of irradiation on different regions of the surface and immobilization of different anti-ligands allow formation of an immobilized matrix of anti-ligands at defined sites on the surface. The immobilized matrix of anti-ligands permits simultaneous screenings of a liquid sample for ligands having high affinities for certain anti-ligands of the matrix.

摘要翻译： 具有由具有可光除去保护基团保护的具有硫醇官能团的化合物的表面的底物可用于构建固定化抗配体的阵列，例如寡核苷酸探针或其它生物聚合物。 阵列可以用于测定中以检测样品中互补核酸的存在。 表面上预定区域的空间照射可以使寡核苷酸和其他生物聚合物固定在表面上的活化区域。 在不同表面区域照射的周期和不同抗配体的固定使得能够在表面上的限定位置形成固定的抗配体基团。 抗配体的固定化基质允许对基质的某些抗配体具有高亲和力的配体的液体样品的同时筛选。

公开(公告)号：US20130150248A1

公开(公告)日：2013-06-13

申请号：US12959359

申请日：2010-12-02

申请人： Maureen T. Cronin ,  Charles G. Miyada ,  Earl A. Hubbell ,  Mark Chee ,  Stephen P.A. Fodor ,  Xiaohua C. Huang ,  Robert J. Lipshutz ,  Peter E. Lobban ,  MacDonald S. Morris ,  Edward L. Sheldon

发明人： Maureen T. Cronin ,  Charles G. Miyada ,  Earl A. Hubbell ,  Mark Chee ,  Stephen P.A. Fodor ,  Xiaohua C. Huang ,  Robert J. Lipshutz ,  Peter E. Lobban ,  MacDonald S. Morris ,  Edward L. Sheldon

IPC分类号： C12Q1/68

CPC分类号： C12Q1/6837 ,  B01J19/0046 ,  B01J2219/00432 ,  B01J2219/00529 ,  B01J2219/00605 ,  B01J2219/00608 ,  B01J2219/00612 ,  B01J2219/00617 ,  B01J2219/00626 ,  B01J2219/00644 ,  B01J2219/00659 ,  B01J2219/00711 ,  B01J2219/00722 ,  B82Y30/00 ,  C07B2200/11 ,  C07H21/00 ,  C12Q1/6874 ,  C12Q1/6876 ,  C12Q2600/106 ,  C12Q2600/156 ,  C12Q2600/172 ,  C40B40/06 ,  C40B60/14

摘要： The invention provides arrays of immobilized probes, and methods employing the arrays, for detecting mutations in the biotransformation genes, such as cytochromes P450. For example, one such array comprises four probe sets. A first probe set comprises a plurality of probes, each probe comprising a segment of at least three nucleotides exactly complementary to a subsequence of a reference sequence from a biotransformation gene, the segment including at least one interrogation position complementary to a corresponding nucleotide in the reference sequence. Second, third and fourth probe sets each comprise a corresponding probe for each probe in the first probe set. The probes in the second, third and fourth probe sets are identical to a sequence comprising the corresponding probe from the first probe set or a subsequence of at least three nucleotides thereof that includes the at least one interrogation position, except that the at least one interrogation position is occupied by a different nucleotide in each of the four corresponding probes from the four probe sets.

摘要翻译： 本发明提供了固定化探针的阵列，以及采用该阵列的方法，用于检测生物转化基因如细胞色素P450中的突变。 例如，一个这样的阵列包括四个探针组。 第一探针组包含多个探针，每个探针包含与来自生物转化基因的参考序列的亚序列完全互补的至少三个核苷酸的片段，该片段包含与参考文献中的相应核苷酸互补的至少一个询问位置 序列。 第二，第三和第四探针组各自包括在第一探针组中的每个探针的相应探针。 第二，第三和第四探针组中的探针与包含来自第一探针组的相应探针或包含至少一个询问位置的至少三个核苷酸的亚序列的序列相同，除了至少一个询问 位置由来自四个探针组的四个相应探针中的每一个中的不同核苷酸占据。

公开(公告)号：US07846659B2

公开(公告)日：2010-12-07

申请号：US11401482

申请日：2006-04-11

申请人： Maureen T. Cronin ,  Charles G Miyada ,  Earl A. Hubbell ,  Mark Chee ,  Stephen P. A. Fodor ,  Xiaohua C. Huang ,  Robert J. Lipshutz ,  Peter E. Lobban ,  MacDonald S. Morris ,  Edward L. Sheldon

发明人： Maureen T. Cronin ,  Charles G Miyada ,  Earl A. Hubbell ,  Mark Chee ,  Stephen P. A. Fodor ,  Xiaohua C. Huang ,  Robert J. Lipshutz ,  Peter E. Lobban ,  MacDonald S. Morris ,  Edward L. Sheldon

IPC分类号： C12Q1/68 ,  C12P19/34 ,  C07H21/02 ,  C07H21/04

CPC分类号： C12Q1/6837 ,  B01J19/0046 ,  B01J2219/00432 ,  B01J2219/00529 ,  B01J2219/00605 ,  B01J2219/00608 ,  B01J2219/00612 ,  B01J2219/00617 ,  B01J2219/00626 ,  B01J2219/00644 ,  B01J2219/00659 ,  B01J2219/00711 ,  B01J2219/00722 ,  B82Y30/00 ,  C07B2200/11 ,  C07H21/00 ,  C12Q1/6874 ,  C12Q1/6876 ,  C12Q2600/106 ,  C12Q2600/156 ,  C12Q2600/172 ,  C40B40/06 ,  C40B60/14

摘要： The invention provides arrays of immobilized probes, and methods employing the arrays, for detecting mutations in the biotransformation genes, such as cytochromes P450. For example, one such array comprises four probe sets. A first probe set comprises a plurality of probes, each probe comprising a segment of at least three nucleotides exactly complementary to a subsequence of a reference sequence from a biotransformation gene, the segment including at least one interrogation position complementary to a corresponding nucleotide in the reference sequence. Second, third and fourth probe sets each comprise a corresponding probe for each probe in the first probe set. The probes in the second, third and fourth probe sets are identical to a sequence comprising the corresponding probe from the first probe set or a subsequence of at least three nucleotides thereof that includes the at least one interrogation position, except that the at least one interrogation position is occupied by a different nucleotide in each of the four corresponding probes from the four probe sets.

摘要翻译： 本发明提供了固定化探针的阵列，以及采用该阵列的方法，用于检测生物转化基因如细胞色素P450中的突变。 例如，一个这样的阵列包括四个探针组。 第一探针组包含多个探针，每个探针包含与来自生物转化基因的参考序列的亚序列完全互补的至少三个核苷酸的片段，该片段包含与参考文献中的相应核苷酸互补的至少一个询问位置 序列。 第二，第三和第四探针组各自包括在第一探针组中的每个探针的相应探针。 第二，第三和第四探针组中的探针与包含来自第一探针组的相应探针或包含至少一个询问位置的至少三个核苷酸的亚序列的序列相同，除了至少一个询问 位置由来自四个探针组的四个相应探针中的每一个中的不同核苷酸占据。

公开(公告)号：US07115364B1

公开(公告)日：2006-10-03

申请号：US08510521

申请日：1995-08-02

申请人： Mark Chee ,  Maureen T. Cronin ,  Stephen P. A. Fodor ,  Thomas R. Gingeras ,  Xiaohua C. Huang ,  Earl A. Hubbell ,  Robert J. Lipshutz ,  Peter E. Lobban ,  Charles Garrett Miyada ,  Macdonald S. Morris ,  Nila Shah ,  Edward L. Sheldon

发明人： Mark Chee ,  Maureen T. Cronin ,  Stephen P. A. Fodor ,  Thomas R. Gingeras ,  Xiaohua C. Huang ,  Earl A. Hubbell ,  Robert J. Lipshutz ,  Peter E. Lobban ,  Charles Garrett Miyada ,  Macdonald S. Morris ,  Nila Shah ,  Edward L. Sheldon

IPC分类号： C12Q1/68 ,  G01N33/50 ,  G01N33/53 ,  C07H21/04

CPC分类号： C12Q1/6869 ,  C12Q1/6886 ,  Y02A50/54

摘要： The invention provides chips of immobilized probes, and methods employing the chips, for comparing a reference polynucleotide sequence of known sequence with a target sequence showing substantial similarity with the reference sequence, but differing in the presence of e.g., mutations.

摘要翻译： 本发明提供了固定化探针的芯片，以及使用该芯片的方法，用于将已知序列的参考多核苷酸序列与显示与参考序列基本相似的靶序列进行比较，但在例如突变的存在下不同。

公开(公告)号：US20080261832A1

公开(公告)日：2008-10-23

申请号：US11506176

申请日：2006-08-18

申请人： Maureen T. Cronin ,  Charles Garrett Miyada ,  Earl A. Hubbell ,  Mark Chee ,  Stephen P.A. Fodor ,  Xiaohua C. Huang ,  Robert J. Lipshutz ,  Peter E. Lobban ,  MacDonald S. Morris ,  Edward L. Sheldon

发明人： Maureen T. Cronin ,  Charles Garrett Miyada ,  Earl A. Hubbell ,  Mark Chee ,  Stephen P.A. Fodor ,  Xiaohua C. Huang ,  Robert J. Lipshutz ,  Peter E. Lobban ,  MacDonald S. Morris ,  Edward L. Sheldon

IPC分类号： C40B40/06 ,  C40B50/14

CPC分类号： C12Q1/6874 ,  C12Q1/6886

摘要： The invention provides arrays of immobilized probes, and methods employing the arrays, for detecting mutations in the CFTR gene.

摘要翻译： 本发明提供了固定化探针的阵列，以及采用阵列的方法，用于检测CFTR基因中的突变。

公开(公告)号：US06375899B1

公开(公告)日：2002-04-23

申请号：US09203730

申请日：1998-12-02

申请人： Donald E. Ackley ,  Edward L. Sheldon ,  Michael K. Krihak

发明人： Donald E. Ackley ,  Edward L. Sheldon ,  Michael K. Krihak

IPC分类号： G01N100

CPC分类号： B01J19/0046 ,  B01J19/0093 ,  B01J2219/00315 ,  B01J2219/00317 ,  B01J2219/00527 ,  B01J2219/00585 ,  B01J2219/0059 ,  B01J2219/00596 ,  B01J2219/00605 ,  B01J2219/0061 ,  B01J2219/00612 ,  B01J2219/00614 ,  B01J2219/00617 ,  B01J2219/00621 ,  B01J2219/00626 ,  B01J2219/00637 ,  B01J2219/00653 ,  B01J2219/00659 ,  B01J2219/00686 ,  B01J2219/00689 ,  B01J2219/00702 ,  B01J2219/00713 ,  B01J2219/0072 ,  B01J2219/00722 ,  B01J2219/00725 ,  B01J2219/00731 ,  B01L3/502707 ,  B01L3/502723 ,  B01L3/50273 ,  B01L3/502738 ,  B01L3/502753 ,  B01L3/502761 ,  B01L3/5085 ,  B01L7/52 ,  B01L2200/0647 ,  B01L2200/0684 ,  B01L2300/0636 ,  B01L2300/0645 ,  B01L2300/0816 ,  B01L2300/0877 ,  B01L2300/0887 ,  B01L2400/0415 ,  B01L2400/0421 ,  B01L2400/0424 ,  B01L2400/0475 ,  B82Y5/00 ,  B82Y10/00 ,  C07B2200/11 ,  C07H21/00 ,  C07K1/04 ,  C07K1/045 ,  C07K1/047 ,  C12Q1/6813 ,  C12Q1/6816 ,  C12Q1/6825 ,  C12Q1/6837 ,  C40B40/06 ,  C40B40/10 ,  C40B40/12 ,  C40B60/14 ,  F04B19/006 ,  G01N27/44743 ,  G11C13/0014 ,  G11C13/0019 ,  G11C13/04 ,  G11C19/00 ,  H01L25/50 ,  H01L2924/0002 ,  C12Q2565/515 ,  C12Q2565/607 ,  H01L2924/00

摘要： Methods, apparatus, and applications for use of a stacked, reconfigurable system for electrophoretic transport are provided. In one embodiment, a system having a first chamber including at least a bottom support and an intermediate support, and a second chamber, said second chamber including a bottom support and a top member, the first and second chambers being coupled through a via. Electrophoretic, and optional electro-osmotic and thermal, transport is effected. In another aspect of this invention, three or more chambers are coupled by an electrophoretic buss. The electrophoretic buss includes driving electrodes and is adapted to receive fluid containing materials for transport. The chambers are coupled to the electrophoretic buss and serve as a tap from the buss for delivery of charged materials. In one embodiment, certain functions are performed in different chambers. For example, the first chamber may receive the sample and perform sample processing functions, the second chamber may perform amplification procedures, yet a third chamber may perform hybridization or other assays, and yet another chamber may perform immunoassays. By separating various functions to different chambers, speed and sensitivity may be improved. In yet another aspect of this invention, analysis from a earlier stage may be utilized in a subsequent stage to reconfigure the system for optimum use. In one application, analysis at a first level is utilized to determine an action at a second level, such as the synthesis of a compound. The synthesized compound in response to a biohazard may comprise vaccine or antidote.

摘要翻译： 提供了用于电泳运输的堆叠的可重新配置的系统的方法，装置和应用。 在一个实施例中，具有至少包括底部支撑件和中间支撑件的第一室的系统和第二室，所述第二室包括底部支撑件和顶部构件，所述第一室和第二室通过通孔联接。 进行电泳和可选的电渗透和热传输。 在本发明的另一方面，三个或更多个室通过电泳总线耦合。 电泳总线包括驱动电极并且适于接收含有运输材料的流体。 这些室被耦合到电泳总线上，并且用作用于传送带电材料的总线的水龙头。 在一个实施例中，在不同的室中执行某些功能。 例如，第一腔室可以接收样品并执行样品处理功能，第二腔室可以进行扩增过程，而第三腔室可以进行杂交或其他测定，而另一个室可以进行免疫测定。 通过将各种功能分离到不同的室，可以提高速度和灵敏度。 在本发明的另一方面，可以在后续阶段利用来自较早阶段的分析来重新配置系统以获得最佳使用。 在一个应用中，利用第一级的分析来确定第二级的作用，例如化合物的合成。 响应于生物危害的合成化合物可以包含疫苗或解毒剂。

公开(公告)号：US5888728A

公开(公告)日：1999-03-30

申请号：US484968

申请日：1995-06-07

申请人： John D. Olson ,  Robert F. Zuk ,  Richard D. Armenta ,  Charles R. Burke ,  Viola T. Kung ,  Edward L. Sheldon

发明人： John D. Olson ,  Robert F. Zuk ,  Richard D. Armenta ,  Charles R. Burke ,  Viola T. Kung ,  Edward L. Sheldon

IPC分类号： C07H21/00 ,  C12Q1/68 ,  G01N33/537 ,  G01N33/543 ,  C07H19/00 ,  G01N33/566

CPC分类号： G01N33/5308 ,  C07H21/00 ,  C07K14/765 ,  C12Q1/6834 ,  G01N33/537 ,  G01N33/54306 ,  G01N33/54353 ,  Y10S436/823

摘要： The present invention encompasses a capture membrane comprising a porous filter membrane having a hapten bound directly or indirectly to the membrane wherein complexes formed by specific binding having an anti-hapten bound to a binding member of the specifically binding complex are removed from a solution by the hapten as the solution passes through the membrane. In the preferred embodiment biotin is the hapten and avidin or streptavidin is the anti-hapten.

摘要翻译： 本发明包括一种捕获膜，其包括具有直接或间接结合膜的半抗原的多孔过滤膜，其中通过特异性结合形成的具有与结合特异性结合复合物的结合成员结合的抗半抗原形成的复合物通过 半抗原溶液通过膜。 在优选实施方案中，生物素是半抗原，抗生物素蛋白或链霉亲和素是抗半抗原。

公开(公告)号：US5837832A

公开(公告)日：1998-11-17

申请号：US441887

申请日：1995-05-16

申请人： Mark Chee ,  Maureen T. Cronin ,  Stephen P. A. Fodor ,  Xiaohua X. Huang ,  Earl A. Hubbell ,  Robert J. Lipshutz ,  Peter E. Lobban ,  MacDonald S. Morris ,  Edward L. Sheldon

发明人： Mark Chee ,  Maureen T. Cronin ,  Stephen P. A. Fodor ,  Xiaohua X. Huang ,  Earl A. Hubbell ,  Robert J. Lipshutz ,  Peter E. Lobban ,  MacDonald S. Morris ,  Edward L. Sheldon

IPC分类号： B01J19/00 ,  C07B61/00 ,  C07H21/00 ,  C12Q1/68 ,  C40B40/06 ,  C40B60/14

CPC分类号： C07H21/00 ,  B01J19/0046 ,  B82Y30/00 ,  B01J2219/00432 ,  B01J2219/00529 ,  B01J2219/00596 ,  B01J2219/00608 ,  B01J2219/00612 ,  B01J2219/00626 ,  B01J2219/00659 ,  B01J2219/00689 ,  B01J2219/00711 ,  B01J2219/00722 ,  C07B2200/11 ,  C40B40/06 ,  C40B60/14

摘要： DNA chips containing arrays of oligonucleotide probes can be used to determine whether a target nucleic acid has a nucleotide sequence identical to or different from a specific reference sequence. The array of probes comprises probes exactly complementary to the reference sequence, as well as probes that differ by one or more bases from the exactly complementary probes.

摘要翻译： 可以使用含有寡核苷酸探针阵列的DNA芯片来确定靶核酸是否具有与特定参考序列相同或不同的核苷酸序列。 探针阵列包括与参考序列完全互补的探针，以及与精确互补探针不同的一个或多个碱基的探针。