公开(公告)号：US20130302797A1

公开(公告)日：2013-11-14

申请号：US13803741

申请日：2013-03-14

申请人： Anne R. Kopf-Sill ,  Lena Wu ,  Roland Stoughton

发明人： Anne R. Kopf-Sill ,  Lena Wu ,  Roland Stoughton

IPC分类号： G01N33/50

CPC分类号： G01N33/57488 ,  C12Q1/6883 ,  C12Q1/6886 ,  C12Q2600/118 ,  C12Q2600/156 ,  G01N1/31 ,  G01N33/5091 ,  G01N33/57484 ,  G01N33/57492 ,  G01N2333/705 ,  G01N2333/71 ,  G01N2333/912 ,  G01N2333/96433

摘要： The invention encompasses methods for diagnosing, theranosing, or prognosing a condition in a patient based on the results of one or more analysis methods. The methods can comprise enriching a sample obtained from the patient for one or more rare cells. The analysis methods can include performing enumeration of the one or more rare cells or cell subtypes, performing nucleic acid analysis, or detecting a serum marker.

公开(公告)号：US20100233693A1

公开(公告)日：2010-09-16

申请号：US12595949

申请日：2008-04-16

申请人： Anne R. Kopf-Sill ,  Lena Wu ,  Roland Stoughton

发明人： Anne R. Kopf-Sill ,  Lena Wu ,  Roland Stoughton

IPC分类号： C12Q1/68 ,  G01N33/574

CPC分类号： G01N33/57488 ,  C12Q1/6883 ,  C12Q1/6886 ,  C12Q2600/118 ,  C12Q2600/156 ,  G01N1/31 ,  G01N33/5091 ,  G01N33/57484 ,  G01N33/57492 ,  G01N2333/705 ,  G01N2333/71 ,  G01N2333/912 ,  G01N2333/96433

摘要： The invention encompasses methods for diagnosing, theranosing, or prognosing a condition in a patient based on the results of one or more analysis methods. The methods can comprise enriching a sample obtained from the patient for one or more rare cells. The analysis methods can include performing enumeration of the one or more rare cells or cell subtypes, performing nucleic acid analysis, or detecting a serum marker.

摘要翻译： 本发明包括基于一种或多种分析方法的结果来诊断，鉴别或预测患者病症的方法。 所述方法可以包括富集从患者获得的一种或多种稀有细胞的样品。 分析方法可以包括执行一个或多个稀有细胞或细胞亚型的计数，进行核酸分析或检测血清标记。

公开(公告)号：US07998411B2

公开(公告)日：2011-08-16

申请号：US10840763

申请日：2004-05-05

申请人： Anne R. Kopf-Sill ,  Carol T. Schembri

发明人： Anne R. Kopf-Sill ,  Carol T. Schembri

IPC分类号： G01N9/30 ,  G01N35/00

CPC分类号： B01L3/502738 ,  B01L2300/0806 ,  B01L2300/0867 ,  B01L2300/087 ,  B01L2400/0409 ,  G01N21/07 ,  Y10T436/111666 ,  Y10T436/25375 ,  Y10T436/2575

摘要： The present invention provides centrifugal rotors for delivering a premeasured volume of liquid to a chamber in the rotor. In particular the rotors comprise siphons for delivering a premeasured volume of liquid between a first and a second chamber in the rotor. The siphons of the invention are designed such that the inlet of the siphon on the first chamber is radially outward of the siphon outlet on the second chamber. The first chamber is emptied to a level equivalent to the radial position of the siphon outlet.

摘要翻译： 本发明提供了用于将预先测量的体积的液体输送到转子中的室的离心转子。 特别地，转子包括用于在转子中的第一和第二室之间递送预先测量的液体体积的虹吸管。 本发明的虹吸设计成使得第一室上的虹吸入口在第二室上的虹吸出口的径向外侧。 第一个室被排空到与虹吸出口的径向位置相当的水平。

公开(公告)号：US07645581B2

公开(公告)日：2010-01-12

申请号：US11867626

申请日：2007-10-04

申请人： Michael R. Knapp ,  Jill M. Baker ,  Andrea W. Chow ,  Anne R. Kopf-Sill ,  Michael A. Spaid

发明人： Michael R. Knapp ,  Jill M. Baker ,  Andrea W. Chow ,  Anne R. Kopf-Sill ,  Michael A. Spaid

IPC分类号： C12Q1/68 ,  C12P19/34

CPC分类号： C12Q1/6851 ,  B01L3/5027 ,  B01L3/502761 ,  B01L7/52 ,  B01L7/525 ,  B01L2200/10 ,  B01L2200/16 ,  B01L2300/0816 ,  B01L2300/0864 ,  B01L2300/0867 ,  B01L2300/1822 ,  B01L2300/1827 ,  B01L2300/1833 ,  B01L2400/0406 ,  B01L2400/0415 ,  B01L2400/0487 ,  C12Q1/6818 ,  C12Q1/6837 ,  C12Q1/686 ,  C12Q1/6869 ,  G01N21/6428 ,  G01N2021/6441 ,  C12Q2565/102 ,  C12Q2537/143 ,  C12Q2545/113 ,  C12Q2531/113 ,  C12Q2565/629 ,  C12Q2527/143

摘要： Methods for determining nucleic acid fragmentation status are provided. A nucleic acid of interest in a reaction mixture is contacted with two or more different probes complementary to sites separated by a point of potential fragmentation. The probes each comprise a detectable marker. The nucleic acid of interest is flowed into a detection region, where two or more coincident detectable marker signals from the probes are detected. Fragmentation status of the nucleic acid of interest is determined, coincident detection of signals from two or more of the different probes indicating the nucleic acid of interest is not fragmented between the probes.

摘要翻译： 提供了确定核酸碎裂状态的方法。 将反应混合物中感兴趣的核酸与两个或更多个不同的探针接触，所述探针与通过潜在断裂点分离的位点互补。 探针各自包含可检测标记。 感兴趣的核酸流入检测区域，其中检测到来自探针的两个或多个重合的可检测标记信号。 确定感兴趣的核酸的碎裂状态，来自两个或更多个指示感兴趣的核酸的不同探针的信号的一致检测在探针之间不分段。

公开(公告)号：US20080131904A1

公开(公告)日：2008-06-05

申请号：US12017859

申请日：2008-01-22

申请人： J. Wallace Parce ,  Theo T. Nikiforov ,  Tammy Burd Mehta ,  Anne R. Kopf-Sill ,  Andrea W. Chow ,  Michael R. Knapp

发明人： J. Wallace Parce ,  Theo T. Nikiforov ,  Tammy Burd Mehta ,  Anne R. Kopf-Sill ,  Andrea W. Chow ,  Michael R. Knapp

IPC分类号： C12Q1/68

CPC分类号： C12Q1/6874 ,  B01F13/0059 ,  B01J2219/00317 ,  B01J2219/00459 ,  B01J2219/00468 ,  B01L3/5027 ,  B01L3/502715 ,  B01L3/502761 ,  B01L2200/0668 ,  B01L2400/0409 ,  B01L2400/0415 ,  B01L2400/043 ,  B01L2400/0487 ,  C07H21/02 ,  C07H21/04 ,  C12Q1/6869 ,  C40B60/14 ,  G01N27/44756 ,  G01N35/0098 ,  G01N2035/00574 ,  Y10T436/143333 ,  C12Q2565/629 ,  C12Q2535/101 ,  C12Q2563/173 ,  C12Q2525/186 ,  C12Q2527/125

摘要： Nucleotides and nucleotide analogs are used in various sequencing by incorporation/sequencing by synthesis methods. Nucleotide analogs comprising 3′-blocking groups are used to provide reversible chain-termination for sequencing by synthesis. Typical blocking groups include phosphate groups and carbamate groups. Fluorescent nucleotides are used to perform sequencing by synthesis with detection by incorporation of the fluorescently labeled nucleotide, optionally followed by photobleaching and intercalating dyes are used to detect addition of a non-labeled nucleotide in sequencing by synthesis with detection by intercalation. Microfluidic devices, including particle arrays, are used in the sequencing methods.

摘要翻译： 核苷酸和核苷酸类似物通过合成方法的并入/测序用于各种测序。 包含3'-封闭基团的核苷酸类似物用于提供可逆的链终止，用于通过合成进行测序。 典型的封闭基团包括磷酸基和氨基甲酸酯基。 使用荧光核苷酸进行测序，通过掺入荧光标记的核苷酸进行检测，任选地随后进行光漂白，并使用嵌入染料检测通过插入检测合成测序中的未标记核苷酸的添加。 微流控器件，包括粒子阵列，用于测序方法。

公开(公告)号：US07285411B1

公开(公告)日：2007-10-23

申请号：US09721508

申请日：2000-11-22

申请人： John Wallace Parce ,  Anne R. Kopf-Sill ,  Luc J. Bousse

发明人： John Wallace Parce ,  Anne R. Kopf-Sill ,  Luc J. Bousse

IPC分类号： C12M1/00 ,  C12M1/34 ,  C12M3/00 ,  G01N27/26

CPC分类号： B01L3/502784 ,  B01J19/0093 ,  B01L3/5025 ,  B01L3/502761 ,  B01L2200/0647 ,  B01L2200/0673 ,  B01L2300/0816 ,  B01L2300/0861 ,  B01L2400/0415 ,  G01N33/5008 ,  G01N33/5304 ,  G01N33/57415 ,  G01N35/08

摘要： The present invention provides novel microfluidic devices and methods that are useful for performing high-throughput screening assays. In particular, the devices and methods of the invention are useful in screening large numbers of different compounds for their effects on a variety of chemical, and preferably, biochemical systems.

摘要翻译： 本发明提供了可用于进行高通量筛选测定的新型微流体装置和方法。 特别地，本发明的装置和方法可用于筛选大量不同的化合物，因为它们对多种化学品，优选生物化学体系的影响。

公开(公告)号：US07156969B2

公开(公告)日：2007-01-02

申请号：US10701652

申请日：2003-11-05

申请人： Tammy Burd Mehta ,  Anne R. Kopf-Sill

发明人： Tammy Burd Mehta ,  Anne R. Kopf-Sill

IPC分类号： G01N27/26

CPC分类号： G01N27/44791 ,  B01J19/0093 ,  B01J2219/00828 ,  B01J2219/00831 ,  B01J2219/00833 ,  B01J2219/00853 ,  B01J2219/00873 ,  B01J2219/00889 ,  B01J2219/00891 ,  B01J2219/00909 ,  B01J2219/00912 ,  B01J2219/00961 ,  B01J2219/00986 ,  B01L3/5027 ,  B01L3/502784 ,  B01L7/52 ,  B01L2200/0673 ,  B01L2200/10 ,  B01L2300/0816 ,  B01L2300/0867 ,  B01L2300/1827 ,  B01L2400/0418 ,  B01L2400/0421 ,  B01L2400/0487 ,  Y10S435/814

摘要： Multiphasic microfluidic apparatus for performing product fluid manipulation and separation in a single continuous unit are provided. Related methods, kits, and compositions are also provided.

摘要翻译： 提供了用于在单个连续单元中执行产品流体操纵和分离的多相微流体装置。 还提供了相关方法，试剂盒和组合物。

公开(公告)号：US07105300B2

公开(公告)日：2006-09-12

申请号：US10413049

申请日：2003-04-14

申请人： J. Wallace Parce ,  Theo T. Nikiforov ,  Tammy Burd Mehta ,  Anne R. Kopf-Sill ,  Andrea W. Chow ,  Michael R. Knapp

发明人： J. Wallace Parce ,  Theo T. Nikiforov ,  Tammy Burd Mehta ,  Anne R. Kopf-Sill ,  Andrea W. Chow ,  Michael R. Knapp

IPC分类号： C12Q1/68 ,  C12P19/34 ,  C07H19/04

CPC分类号： C12Q1/6874 ,  B01F13/0059 ,  B01J2219/00317 ,  B01J2219/00459 ,  B01J2219/00468 ,  B01L3/5027 ,  B01L3/502715 ,  B01L3/502761 ,  B01L2200/0668 ,  B01L2400/0409 ,  B01L2400/0415 ,  B01L2400/043 ,  B01L2400/0487 ,  C07H21/02 ,  C07H21/04 ,  C12Q1/6869 ,  C40B60/14 ,  G01N27/44756 ,  G01N35/0098 ,  G01N2035/00574 ,  Y10T436/143333 ,  C12Q2565/629 ,  C12Q2535/101 ,  C12Q2563/173 ,  C12Q2525/186 ,  C12Q2527/125

摘要： Nucleotides and nucleotide analogs are used in various sequencing by incorporation/sequencing by synthesis methods. Nucleotide analogs comprising 3′-blocking groups are used to provide reversible chain-termination for sequencing by synthesis. Typical blocking groups include phosphate groups and carbamate groups. Fluorescent nucleotides are used to perform sequencing by synthesis with detection by incorporation of the fluorescently labeled nucleotide, optionally followed by photobleaching and intercalating dyes are used to detect addition of a non-labeled nucleotide in sequencing by synthesis with detection by intercalation. Microfluidic devices, including particle arrays, are used in the sequencing methods.

公开(公告)号：US06703205B2

公开(公告)日：2004-03-09

申请号：US10102149

申请日：2002-03-19

申请人： Anne R. Kopf-Sill ,  Andrea W. Chow ,  Claudia B. Cohen ,  Steven A. Sundberg ,  John Wallace Parce

发明人： Anne R. Kopf-Sill ,  Andrea W. Chow ,  Claudia B. Cohen ,  Steven A. Sundberg ,  John Wallace Parce

IPC分类号： G01N33558

CPC分类号： G01N33/557 ,  B01J19/0093 ,  B01J2219/0095 ,  B01J2219/0097 ,  B01J2219/00995 ,  B01L3/5027 ,  B01L3/50273 ,  B01L3/502746 ,  B01L3/563 ,  B01L9/527 ,  B01L2200/14 ,  B01L2200/143 ,  B01L2300/0627 ,  B01L2300/0816 ,  B01L2300/0867 ,  B01L2400/0415 ,  G01N27/447 ,  G01N27/44726 ,  G01N27/44791 ,  Y10S435/81 ,  Y10S436/805 ,  Y10S436/809

摘要： Electrokinetic devices having a computer for correcting for electrokinetic effects are provided. Methods of correcting for electrokinetic effects by establishing the velocity of reactants and products in a reaction in electrokinetic microfluidic devices are also provided. These microfluidic devices can have substrates with channels, depressions, and/or wells for moving, mixing and monitoring precise amounts of analyte fluids.

摘要翻译： 提供了具有用于校正电动效果的计算机的电动装置。 还提供了通过在电动微流体装置中确定反应物和产物在反应中的速度来校正电动效应的方法。 这些微流体装置可以具有用于移动，混合和监测精确量的分析物流体的通道，凹陷和/或孔的基底。

公开(公告)号：US06632655B1

公开(公告)日：2003-10-14

申请号：US09510626

申请日：2000-02-22

申请人： Tammy Burd Mehta ,  Anne R. Kopf-Sill ,  J. Wallace Parce ,  Andrea W. Chow ,  Luc J. Bousse ,  Michael R. Knapp ,  Theo T. Nikiforov ,  Steve Gallagher

发明人： Tammy Burd Mehta ,  Anne R. Kopf-Sill ,  J. Wallace Parce ,  Andrea W. Chow ,  Luc J. Bousse ,  Michael R. Knapp ,  Theo T. Nikiforov ,  Steve Gallagher

IPC分类号： C12M140

CPC分类号： C12Q1/6874 ,  B01F13/0059 ,  B01J2219/00317 ,  B01J2219/00459 ,  B01J2219/00468 ,  B01L3/5027 ,  B01L3/502715 ,  B01L3/502761 ,  B01L2200/0668 ,  B01L2400/0409 ,  B01L2400/0415 ,  B01L2400/043 ,  B01L2400/0487 ,  C07H21/02 ,  C07H21/04 ,  C12Q1/6869 ,  C40B60/14 ,  G01N27/44756 ,  G01N35/0098 ,  G01N2035/00574 ,  Y10T436/143333 ,  C12Q2565/629 ,  C12Q2535/101 ,  C12Q2563/173 ,  C12Q2525/186 ,  C12Q2527/125

摘要： Arrays of flowable or fixed particle sets are used in microfluidic systems for performing assays and modifying hydrodynamic flow. Also provided are assays utilizing flowable or fixed particle sets within a microfluidic system, as well as kits, apparatus and integrated systems comprising arrays and array members.

摘要翻译： 可流动或固定的颗粒组的数组用于微流体系统中，用于进行测定和改变流体动力学流动。 还提供了利用微流体系统内的可流动或固定的颗粒组的测定法，以及包括阵列和阵列成员的试剂盒，装置和集成系统。